L’équipe oriente ses travaux autour de deux questions principales :

1. Quels sont les facteurs environnementaux (biotiques et abiotiques) qui contrôlent la diversité des cyanobactéries et des métabolites qu’elles produisent dans les écosystèmes aquatiques continentaux (causes) ?
2. Quels sont les effets des cyanobactéries sur le fonctionnement des écosystèmes aquatiques (conséquences) ?

Pour répondre à ces questions, l’équipe s’appuie sur des approches issues de l’écotoxicologie, de l’écologie microbienne, de l’écologie chimique.

Ces questions se déclinent en objectifs plus spécifiques :

- Revisiter la diversité microbienne et chimique des écosystèmes aquatiques, et en particulier des cyanobactéries et des microalgues afin de comprendre les liens entre diversité taxonomique et fonctionnement de ces écosystèmes. Les questions sont abordées à différents niveaux d’interactions (boucle microbienne, interactions micro- macro-organismes) et d’échelles (temps, espace). en s’appuyant sur des expérimentations en conditions contrôlées (micro- et mésocosmes) et sur des méthodes OMICs et NGS (axe 1)

- Intégrer les connaissances obtenues à différentes échelles par des approches de modélisation qui permettent une meilleure compréhension des interactions entre cyanobactéries et autres organismes, dans un contexte environnemental, allant jusqu’à la construction de scenarios de prédiction (axe 2)

- Etudier les mécanismes qui contribuent à l’adaptation et l’acclimatation des cyanobactéries aux stress environnementaux. Cet objectif s’appuie sur les collections du MNHN (cyanobactéries & microalgues) dont les souches proviennent d’environnements variés (axe 3)

- Comprendre les réponses des organismes et des communautés soumis aux multi-contaminations des écosystèmes aquatiques et dans ce contexte, identifier des signatures de stress spécifiques aux cyanobactéries et à leurs toxines (axe 3)

- Intégrer les connaissances scientifiques sur les proliférations de cyanobactéries aux processus de prise de décision par le transfert de connaissances aux parties prenantes, et par le développement d’interfaces entre sciences environnementales et sociales (axe 4)

Les membres de l’équipe CCE couvrent des domaines complémentaires et l’équipe a progressivement développé un réseau étendu de collaborations nationales et internationales aux compétences complémentaires de celles de l’équipe.

Représentation schématique des thèmes de recherche de CCE (biodiversité, modélisation, écotoxicologie, gestion du risque) montrant que ces thèmes sont inter-connectés, et faisant ressortir le lien entre environnements aquatiques continentaux et pressions anthropiques, ces dernières ayant un impact sur la biodiversité et le fonctionnement de ces écosystèmes, et sur les services qu’ils rendent (© C. Bernard, MNHN).

Crédits

© C. Bernard, MNHN

La situation du sujet, dans le contexte national et international, et ses enjeux sont en grande partie ceux décrits dans le lien suivant :

Collaborations

iEES, MARBEC, ANSES, ENVA, ESPCI, IPGP, LIENS, Ecologie Microbienne Lyon, Institut Pasteur (Paris, Abidjan), I2BC (CEA), Naffiri Center & Univ. Makerré (Ouganda) …

Réséaux

GIS Cyano

Ecotoxicomics

GDR Aquatic toxicology

RFMF

Metabohub

Financement

Muséum National D’Histoire Naturelle

CNRS – INEE

LABEX BcDIV

CNRS EC2CO

ANR Programs: OSS-Cyano, PULSE, DZIANI, CYPHER

FFEM (french fund for the mondial environment): project WaSAf (http://humbert19.wixsite.com/wasaf)