L’équipe Cyanobactéries, Cyanotoxines et Environnement s’intéresse à l’écotoxicologie, l’écologie microbienne et l’écologie chimique des écosystèmes aquatiques continentaux et tout particulièrement à la diversité taxonomique, au rôle fonctionnel ainsi qu’aux impacts écotoxicologiques des cyanobactéries.

Thèmes de recherche

 

L’équipe oriente ses travaux autour de deux questions principales :

  1. Quels sont les facteurs environnementaux (biotiques et abiotiques) qui contrôlent la diversité des cyanobactéries et des métabolites qu’elles produisent dans les écosystèmes aquatiques continentaux (causes) ?
  2. Quels sont les effets des cyanobactéries sur le fonctionnement des écosystèmes aquatiques (conséquences) ?

 

Pour répondre à ces questions, l’équipe s’appuie sur des approches issues de l’écotoxicologie, de l’écologie microbienne, de l’écologie chimique.

 

Ces questions se déclinent en objectifs plus spécifiques :

- Revisiter la diversité microbienne et chimique des écosystèmes aquatiques, et en particulier des cyanobactéries et des microalgues afin de comprendre les liens entre diversité taxonomique et fonctionnement de ces écosystèmes. Les questions sont abordées à différents niveaux d’interactions (boucle microbienne, interactions micro- macro-organismes) et d’échelles (temps, espace). en s’appuyant sur des expérimentations en conditions contrôlées (micro- et mésocosmes) et sur des méthodes OMICs et NGS (axe 1)

- Intégrer les connaissances obtenues à différentes échelles par des approches de modélisation qui permettent une meilleure compréhension des interactions entre cyanobactéries et autres organismes, dans un contexte environnemental, allant jusqu’à la construction de scenarios de prédiction (axe 2)

- Etudier les mécanismes qui contribuent à l’adaptation et l’acclimatation des cyanobactéries aux stress environnementaux. Cet objectif s’appuie sur les collections du MNHN (cyanobactéries & microalgues) dont les souches proviennent d’environnements variés (axe 3)

- Comprendre les réponses des organismes et des communautés soumis aux multi-contaminations des écosystèmes aquatiques et dans ce contexte, identifier des signatures de stress spécifiques aux cyanobactéries et à leurs toxines (axe 3)

- Intégrer les connaissances scientifiques sur les proliférations de cyanobactéries aux processus de prise de décision par le transfert de connaissances aux parties prenantes, et par le développement d’interfaces entre sciences environnementales et sociales (axe 4)

 

Les membres de l’équipe CCE couvrent des domaines complémentaires et l’équipe a progressivement développé un réseau étendu de collaborations nationales et internationales aux compétences complémentaires de celles de l’équipe.

 

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Représentation schématique des thèmes de recherche de CCE (biodiversité, modélisation, écotoxicologie, gestion du risque) montrant que ces thèmes sont inter-connectés, et faisant ressortir le lien entre environnements aquatiques continentaux et pressions anthropiques, ces dernières ayant un impact sur la biodiversité et le fonctionnement de ces écosystèmes, et sur les services qu’ils rendent (© C. Bernard, MNHN).
Crédits
© C. Bernard, MNHN

La situation du sujet, dans le contexte national et international, et ses enjeux sont en grande partie ceux décrits dans le lien suivant :

 

Collaborations

iEES, MARBEC, ANSES, ENVA, ESPCI, IPGP, LIENS, Ecologie Microbienne Lyon, Institut Pasteur (Paris, Abidjan), I2BC (CEA), Naffiri Center & Univ. Makerré (Ouganda) …

 

Réséaux

GIS Cyano

Ecotoxicomics

GDR Aquatic toxicology

RFMF

Metabohub

 

Financement

Muséum National D’Histoire Naturelle

CNRS – INEE

LABEX BcDIV

CNRS EC2CO

ANR Programs: OSS-Cyano, PULSE, DZIANI, CYPHER

FFEM (french fund for the mondial environment): project WaSAf (http://humbert19.wixsite.com/wasaf)

Composition de l'équipe

 

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Crédits
©Charlotte Duval

Responsable

MARIE Benjamin Chargé de Recherche, CNRS

Composition

ALOUI Haietz Gestionnaire, MNHN
BERNARD Cécile Professeure, MNHN

BILLIALD Philippe 

Professeur des Universités,

Paris-Sud

BOULY Jean-Pierre Maître de conférences, Sorbonne Université

CATHERINE Arnaud

Maître de conférences, MNHN

Détachement

DUPERRON Sébastien

Professeur, MNHN

DUVAL Charlotte

Assistante Ingénieure, MNHN

HALARY Sébastien Maître de conférences, MNHN

HAMLAOUI Sahima

Chargée d'études, CDI, MNHN

LANCE Emilie Maître de conférences, Université Reims

QUIBLIER Catherine

Professeure, Université Paris 7

QUIQUAND Manon Chargée d'études, CDD, MNHN
MESLI Siham Ingénieure, CDD, MNHN

SANTHIRAKUMAR Kandiah

Adjoint technique, MNHN

YÉPRÉMIAN Claude

Ingénieur d'études, MNHN

Doctorants et Post-doctorants

DEMAY Justine Post-Doctorante

FOUCAULT Pierre

Doctorant

ORGEAS-GOBIN Samuel Doctorant
ROUSSEL Théotime Doctorant
SEIJO-TOUCEDA Inés Doctorante
WANG Huibin Doctorant
Publié le : 30/11/2017 14:33 - Mis à jour le : 15/11/2023 10:24
Bacille © MNHN

BIM Biochimie des Interactions Microbiennes

Voir l'équipe de recherche "Biochimie des Interactions Microbiennes"

Azote liquide.jpeg

CPNF Chimie des produits naturels fongiques

Voir l'équipe de recherche "Chimie des produits naturels fongiques".

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PPL Parasites et Protistes Libres

Voir l'équipe de recherche "Biodiversité et Adaptation des Microorganismes Eucaryotes à leur Environnement"