Les interactions des micro-organismes avec d'autres micro-organismes ou avec des plantes font intervenir une communication chimique médiée par des petites molécules. La chimie des substances naturelles et l'écologie chimique permettent une approche moléculaire de ces phénomènes. Notre activité a pour but d'étudier la nature chimique (complexité, diversité), l'origine biologique et le rôle des métabolites secondaires (les "produits naturels") impliqués dans ces interactions, du gène à la molécule et de leur isolement à leurs synthèses chimique et biologique.

Thèmes de recherche

L’équipe « Chimie des Produits Naturels Fongiques et Bactériens » (CPNFB) est spécialisée en chimie et en écologie chimique des produits naturels microbiens. L’équipe se caractérise par une forte multidisciplinarité alliant chimie analytique, chimie structurale, microbiologie, biologie moléculaire et métabolomique. CPNFB développe des approches globales et intégratives axées sur l'étude des métabolites microbiens. L’équipe est reconnue pour son travail pluridisciplinaire sur les microorganismes endophytes et plus particulièrement sur les endophytes d’origine fongique. L’équipe se positionne comme l'un des rares groupes de recherche en France capable de couvrir ce domaine depuis la caractérisation chimique des métabolites fongiques, leur biosynthèse jusqu'à l'étude de leurs rôles écologiques potentiels, leurs impacts sur l'environnement et leur valorisation.

Ces approches sont également appliquées à des échelles plus macroscopiques comme celle de l’holobionte (plante, algue) où le rôle et l’impact de la médiation chimique dans les interactions intra-microbiote et entre microbiote et hôte sont appréhendées dans des contextes de stress biotique et abiotique. Ces projets sont développés dans l’objectif de fournir des solutions durables dans divers secteurs tels que l'agriculture, la santé, l'alimentation.

 

Les travaux en cours de l’équipe sont organisés en quatre thèmes majeurs :

  1. Caractériser la biosynthèse de composés fongiques par des approches du « gène à la molécule » 
  2. Décrypter la nature et le rôle des interactions moléculaires des endophytes fongiques et leur potentiel de valorisation
  3. Etudier les interactions microbiennes au sein l’holobionte de macro et micro-algues
  4. Appréhender la chimiodiversité fongique par des outils de chimie innovants

 

Notre équipe possède une très large expertise couvrant les domaines suivants : 

 

  • isolement de microorganismes associés aux plantes (endophytes).
  • isolement des métabolites secondaires et étude de leurs activités biologiques et écologiques.
  • détermination structurale des "petites" molécules (métabolites).
  • synthèse totale de produits naturels, bio-inspiration et méthodologies de synthèse.
  • enzymologie des voies de biosynthèse des métabolites secondaires.
  • génétique fongique et biotechnologies.
  • bioconversions par les micro-organismes.

 

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Champignons endophytes - CPNF © Soizic Prado
Champignons endophytes - CPNF © Soizic Prado
Crédits
© Soizic Prado
Composition de l'équipe

Responsable

Soizic PRADO

Professeur, MNHN

Composition

Séverine AMAND

Ingénieur d’étude, MNHN

Didier BUISSON

Directeur de recherche, CNRS

Kevin CALABRO Maître de conférences, MNHN

Delphine CHAMPEVAL

Assistant Ingénieur, CNRS
Pavla DEBELJAK Enseignant Chercheur, SupBiotech
Claire GACHON Professeur, MNHN

Caroline KUNZ

Maître de conférences, Sorbonne Université

Stéphane MANN

Chargé de recherche, CNRS

Membres non permanents

Emilie ADOUANE Doctorante

Benedict BOSTOCK

Doctorant
Gautier DEMOULINGER Doctorant
Maurane DOLLY Technicienne
Lucie FRETIER Ingénieur Etude
Jeanne MIEBACH Doctorante
Steffi SEWSURN Doctorante
Man ZHOU Doctorante

 

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Publié le : 30/11/2017 12:29 - Mis à jour le : 08/12/2023 15:57
Bacille © MNHN

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PPL Parasites et Protistes Libres

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