Les différents thèmes de recherche developpés au sein l'unité
L’objectif scientifique de MCAM est de comprendre l’apport des microorganismes au maintien et à l’évolution des écosystèmes en abordant plusieurs questions clés, telles que:
- La diversité des microorganismes est-elle sous-estimée ?
-Comment et par quels mécanismes des facteurs chimiques (métabolites secondaires, peptides, protéines) interviennent-ils dans la dynamique des interactions entre microorganismes et leur dynamique, entre microorganismes et hôtes, entre microorganismes et leurs milieux?
- Comment les microorganismes contribuent-ils à la stabilité ou à l’évolution des écosystèmes étudiés?
Les recherches s’appuient sur un large panel de microorganismes modèles : bactéries, archées, cyanobactéries, champignons filamenteux, protistes et nématodes dans le cadre d’écosystèmes confinés et d'holobiontes (microbiote intestinal, associations bactéries/invertébrés marins et champignons endophytes/plantes, relations parasites/hôtes) ou ouverts (bactéries, cyanobactéries environnementales) face aux facteurs environnementaux biotiques et abiotiques. Elles s’articulent autour de 4 thèmes interconnectés qui permettent de proposer une approche intégrée allant de la caractérisation des molécules produites par les microorganismes à leurs impacts sur les écosystèmes.
Thème 1 : Diversité et histoire évolutive des microorganismes
Thème 2 : Chimie et biologie des métabolites microbiens
Thème 3 : Relations symbiotiques
Thème 4 : Interactions microorganismes – environnement, écotoxicologie
Cet objectif scientifique se décline dans 4 équipes de recherche s’appuyant sur des plateformes analytiques (spectrométrie de masse, RMN, microscopies électroniques, imageries, cytométrie) et des services mutualisés (microbiologie, isolement et purification de molécules…).
Equipe 1 : Biochimie des Interactions Microbiennes (BIM, responsable : Yanyan Li, CR CNRS)
Equipe 2 : Chimie des Produits Naturels Fongiques (CPNF, responsable : Soizic Prado, PR MNHN)
Equipe 3 : Parasites et Protistes Libres (PPL,responsable : Coralie Martin, PR MNHN )
Equipe 4 : Cyanobactéries, Cyanotoxines et Environnement (CCE, responsable : Benjamin Marie, CR1 CNRS)