La création de MCAM résulte de la volonté de plusieurs Unités du Muséum (l’UMR  5154 Chimie et biochimie des substances naturelles, l’EA 3335 Biologie fonctionnelle des protozoaires et l’EA 4105 Ecosystèmes et interactions toxiques) de regrouper leurs forces et leurs expertises dans différents champs disciplinaires afin de constituer un pôle multidisciplinaire d’étude des mécanismes moléculaires de communication et d’adaptation des microorganismes à leur environnement selon des approches chimique, biochimique, biologique et écologique. Le projet a été soumis à l’AERES en 2008 et l’Unité Molécules de Communication et Adaptation des Microorganismes (MCAM) créée le 1^er janvier 2009 sous le label de FRE 3206 du CNRS, puis reconnue comme Unité Mixte de Recherche du CNRS (UMR 7245), le 1^er janvier 2011, sous la direction du Professeur Sylvie Rebuffat et depuis le 1^er février 2016, sous la direction du Professeur Philippe Grellier. MCAM est une des Unités constituantes du Département Adaptations du Vivant du MNHN.

Les collaborations internationales de l'unité sont illustrées sur la carte interactive.