Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Chimie bio-organique, Enzymologie, Microbiologie, Biotechnologie
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Spécialité
Biosynthèse, Métabolites microbiens, Peptides, Enzymes, Antibiotique, Métaux.

Contact

Courriel
yanyan.li [at] mnhn.fr
Téléphone
01 40 79 57 91
Adresse(s)

43 rue Buffon

24 allée des crapauds

75005 Paris

Responsabilités dans l'unité

  • Responsable de l’équipe BIM, Biochimie des Interactions Microbiennes
  • Animation de l’équipe BIM

Enseignements

Présentation

Activités de recherche

Les microorganismes sont dotés d’une énorme capacité de produire des entités chimiques, dit métabolites secondaires ou spécialisés, qui jouent un rôle important dans l’interaction du microorganisme avec son environnement. Ces molécules sont aussi une source majeure de médicaments. L’accès aux séquences des génomes a révélé le potentiel immense mais sous-exploré des microorganismes à synthétiser de nouveaux métabolites. Mes intérêts de recherche portent sur 1) la découverte des molécules bioactives, notamment des nouveaux antibiotiques, en exploitant la biodiversité microbienne et guidé par l’analyse génomique ; 2) la compréhension et l’ingénierie des voies de biosynthèse ; et 3) la compréhension des rôles fonctionnels de ces métabolites dans l’environnement. Les approches utilisées sont pluridisciplinaires, combinant la chimie, l’enzymologie, la microbiologie, la génomique et la biotechnologie. Les projets en cours focalisent sur les peptides ribosomaux bactériens ayant des propriétés antimicrobiennes ou métallophores.

Sélection des publications antérieures à 2012 :

 

  • Pistorius D, Li Y, Mann S, Müller R. (2011) Unprecedented anthranilate priming involving two enzymes of the acyl adenylating superfamily in aurachin biosynthesis. J Am Chem Soc. 133(32):12362-5.
  • Li Y, Weissman KJ, Müller R. (2008) Myxochelin biosynthesis: direct evidence for two- and four-electron reduction of a carrier protein-bound thioester. J Am Chem Soc. 130(24):7554-5.
  • Li Y, Roux C, Lazereg S, LeCaer JP, Laprévote O, Badet B, Badet-Denisot MA. (2007) Identification of a novel serine phosphorylation site in human glutamine: fructose-6-phosphate amidotransferase isoform 1. Biochemistry. 46(45):13163-9.
  • Llewellyn NM, Li Y, Spencer JB. (2007) Biosynthesis of butirosin: transfer and deprotection of the unique amino acid side chain. Chem Biol. 14(4):379-86.
  • Li Y, Llewellyn NM, Giri R, Huang F, Spencer JB. (2005) Biosynthesis of the unique amino acid side chain of butirosin: possible protective-group chemistry in an acyl carrier protein-mediated pathway. Chem Biol. 12(6):665-75.

Publications

2024
  • Baquero Fernando, Beis Konstantinos, Craik David J., Li Yanyan, Link A. James, Rebuffat Sylvie, Salomón Raúl, Severinov Konstantin, Zirah Séverine & Hegemann Julian D., 2024The pearl jubilee of microcin J25: thirty years of research on an exceptional lasso peptide. Natural Product Reports , ,
    ISSN
    1460-4752
2023
  • Aggarwal Shifu, Huang Elaine, Do Hackwon, Makthal Nishanth, Li Yanyan, Bapteste Eric, Lopez Philippe, Bernard Charles & Kumaraswami Muthiah, 2023The leaderless communication peptide (LCP) class of quorum-sensing peptides is broadly distributed among Firmicutes. Nature Communications vol. 14, n° 1, p. 5947
    ISSN
    2041-1723
  • Bernard Charles, Li Yanyan, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2023Large-Scale Identification of Known and Novel RRNPP Quorum-Sensing Systems by RRNPP_Detector Captures Novel Features of Bacterial, Plasmidic, and Viral Coevolution. Molecular Biology and Evolution vol. 40, n° 4, msad062
    ISSN
    1537-1719
2022
  • Rivas Arenas Laura A., de Paiva Fernanda C. R., de O. Rossini Nicolas, Li YanYan, Spencer Jonathan, Leadlay Peter & Dias Marcio V. B., 2022Crystal structure of BtrK, a decarboxylase involved in the (S)-4-amino-2-hydroxybutyrate (AHBA) formation during butirosin biosynthesis. Journal of Molecular Structure vol. 1267, , p. 133576
    ISSN
    0022-2860
  • Madi-Moussa Désiré, Deracinois Barbara, Teiar Radja, Li Yanyan, Mihasan Marius, Flahaut Christophe, Rebuffat Sylvie, Coucheney Françoise & Drider Djamel, 2022Structure of Lacticaseicin 30 and Its Engineered Variants Revealed an Interplay between the N-Terminal and C-Terminal Regions in the Activity against Gram-Negative Bacteria. Pharmaceutics vol. 14, n° 9, p. 1921
    ISSN
    1999-4923
2021
  • Miethke Marcus, Pieroni Marco, Weber Tilmann, Brönstrup Mark, Hammann Peter, Halby Ludovic, Arimondo Paola B., Glaser Philippe, Aigle Bertrand, Bode Helge B., Moreira Rui, Li Yanyan, Luzhetskyy Andriy, Medema Marnix H., Pernodet Jean-Luc et al., 2021Towards the sustainable discovery and development of new antibiotics. Nature Reviews Chemistry vol. 5, , p. 726-749
    ISSN
    2397-3358
  • Bernard Charles, Li Yanyan, Lopez Philippe & Bapteste Eric, 2021Beyond arbitrium: identification of a second communication system in Bacillus phage phi3T that may regulate host defense mechanisms. The ISME Journal vol. 15, , p. 545-549
    ISSN
    1751-7370
2020
  • Boudrioua Abdelhakim, Li Yanyan, Hartke Axel & Giraud Caroline, avril 2020Opposite effect of vancomycin and D-Cycloserine combination in both vancomycin resistant Staphylococcus aureus and enterococci. FEMS microbiology letters vol. 367, n° 8,
    ISSN
    1574-6968
  • Sayous Victor, Lubrano Paul, Li Yanyan & Acevedo-Rocha Carlos G., 2020Unbiased libraries in protein directed evolution. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics vol. 1868, n° 2, p. 140321
    ISSN
    1570-9639
  • Li Yanyan & Rebuffat Sylvie, 2020The manifold roles of microbial ribosomal peptide-based natural products in physiology and ecology. The Journal of Biological Chemistry vol. 295, n° 1, p. 34-54
    ISSN
    1083-351X