Contact
43 rue Buffon
24 allée des crapauds
75005 Paris
Responsabilités dans l'unité
- Responsable de l’équipe BIM, Biochimie des Interactions Microbiennes
- Animation de l’équipe BIM
Enseignements
- TD Master MNHN « Molécules et Cibles Thérapeutique » : Genome mining of microbial secondary metabolites
- École thématique « Multifonctions de peptides antimicrobiens », 14-18 mars 2016, Quimper, Fran
Présentation
Activités de recherche
Les microorganismes sont dotés d’une énorme capacité de produire des entités chimiques, dit métabolites secondaires ou spécialisés, qui jouent un rôle important dans l’interaction du microorganisme avec son environnement. Ces molécules sont aussi une source majeure de médicaments. L’accès aux séquences des génomes a révélé le potentiel immense mais sous-exploré des microorganismes à synthétiser de nouveaux métabolites. Mes intérêts de recherche portent sur 1) la découverte des molécules bioactives, notamment des nouveaux antibiotiques, en exploitant la biodiversité microbienne et guidé par l’analyse génomique ; 2) la compréhension et l’ingénierie des voies de biosynthèse ; et 3) la compréhension des rôles fonctionnels de ces métabolites dans l’environnement. Les approches utilisées sont pluridisciplinaires, combinant la chimie, l’enzymologie, la microbiologie, la génomique et la biotechnologie. Les projets en cours focalisent sur les peptides ribosomaux bactériens ayant des propriétés antimicrobiennes ou métallophores.
Sélection des publications antérieures à 2012 :
- Pistorius D, Li Y, Mann S, Müller R. (2011) Unprecedented anthranilate priming involving two enzymes of the acyl adenylating superfamily in aurachin biosynthesis. J Am Chem Soc. 133(32):12362-5.
- Li Y, Weissman KJ, Müller R. (2008) Myxochelin biosynthesis: direct evidence for two- and four-electron reduction of a carrier protein-bound thioester. J Am Chem Soc. 130(24):7554-5.
- Li Y, Roux C, Lazereg S, LeCaer JP, Laprévote O, Badet B, Badet-Denisot MA. (2007) Identification of a novel serine phosphorylation site in human glutamine: fructose-6-phosphate amidotransferase isoform 1. Biochemistry. 46(45):13163-9.
- Llewellyn NM, Li Y, Spencer JB. (2007) Biosynthesis of butirosin: transfer and deprotection of the unique amino acid side chain. Chem Biol. 14(4):379-86.
- Li Y, Llewellyn NM, Giri R, Huang F, Spencer JB. (2005) Biosynthesis of the unique amino acid side chain of butirosin: possible protective-group chemistry in an acyl carrier protein-mediated pathway. Chem Biol. 12(6):665-75.
Publications
- 2024 — The pearl jubilee of microcin J25: thirty years of research on an exceptional lasso peptide. Natural Product Reports vol. 121, , e2408304121,ISSN1460-4752
- 2024 — Pyrrolizwilline, a unique bacterial alkaloid assembled by a nonribosomal peptide synthetase and non-enzymatic dimerization. Angewandte Chemie International Edition vol. n/a, n/a, e202411258,ISSN1521-3773
- 2024 — A widespread family of ribosomal peptide metallophores involved in bacterial adaptation to metal stress. Proceedings of the National Academy of Sciences vol. 121, n° 49, e2408304121,
- 2024 — Merging Flow Synthesis and Enzymatic Maturation to Expand the Chemical Space of Lasso Peptides. Journal of the American Chemical Society vol. 146, n° 25, p. 17261-17269,ISSN0002-7863
- 2023 — The leaderless communication peptide (LCP) class of quorum-sensing peptides is broadly distributed among Firmicutes. Nature Communications vol. 14, n° 1, p. 5947,ISSN2041-1723
- 2023 — Large-Scale Identification of Known and Novel RRNPP Quorum-Sensing Systems by RRNPP_Detector Captures Novel Features of Bacterial, Plasmidic, and Viral Coevolution. Molecular Biology and Evolution vol. 40, n° 4, msad062,ISSN1537-1719
- 2022 — Structure of Lacticaseicin 30 and Its Engineered Variants Revealed an Interplay between the N-Terminal and C-Terminal Regions in the Activity against Gram-Negative Bacteria. Pharmaceutics vol. 14, n° 9, p. 1921,ISSN1999-4923
- 2022 — Crystal structure of BtrK, a decarboxylase involved in the (S)-4-amino-2-hydroxybutyrate (AHBA) formation during butirosin biosynthesis. Journal of Molecular Structure vol. 1267, , p. 133576,ISSN0022-2860
- 2021 — Beyond arbitrium: identification of a second communication system in Bacillus phage phi3T that may regulate host defense mechanisms. The ISME Journal vol. 15, , p. 545-549,ISSN1751-7370
- 2021 — Towards the sustainable discovery and development of new antibiotics. Nature Reviews Chemistry vol. 5, , p. 726-749,ISSN2397-3358