Les tutelles
CNRS-MNHN
Yanyan LI
Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Chimie bio-organique, Enzymologie, Microbiologie, Biotechnologie
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Spécialité
Biosynthèse, Métabolites microbiens, Peptides, Enzymes, Antibiotique, Métaux.
Contact
Responsabilités dans l'unité
- Responsable de l’équipe BIM, Biochimie des Interactions Microbiennes
- Animation de l’équipe BIM
Enseignement(s)
- TD Master MNHN « Molécules et Cibles Thérapeutique » : Genome mining of microbial secondary metabolites
- École thématique « Multifonctions de peptides antimicrobiens », 14-18 mars 2016, Quimper, Fran
Activités de recherche
Les microorganismes sont dotés d’une énorme capacité de produire des entités chimiques, dit métabolites secondaires ou spécialisés, qui jouent un rôle important dans l’interaction du microorganisme avec son environnement. Ces molécules sont aussi une source majeure de médicaments. L’accès aux séquences des génomes a révélé le potentiel immense mais sous-exploré des microorganismes à synthétiser de nouveaux métabolites. Mes intérêts de recherche portent sur 1) la découverte des molécules bioactives, notamment des nouveaux antibiotiques, en exploitant la biodiversité microbienne et guidé par l’analyse génomique ; 2) la compréhension et l’ingénierie des voies de biosynthèse ; et 3) la compréhension des rôles fonctionnels de ces métabolites dans l’environnement. Les approches utilisées sont pluridisciplinaires, combinant la chimie, l’enzymologie, la microbiologie, la génomique et la biotechnologie. Les projets en cours focalisent sur les peptides ribosomaux bactériens ayant des propriétés antimicrobiennes ou métallophores.
Sélection des publications antérieures à 2012 :
- Pistorius D, Li Y, Mann S, Müller R. (2011) Unprecedented anthranilate priming involving two enzymes of the acyl adenylating superfamily in aurachin biosynthesis. J Am Chem Soc. 133(32):12362-5.
- Li Y, Weissman KJ, Müller R. (2008) Myxochelin biosynthesis: direct evidence for two- and four-electron reduction of a carrier protein-bound thioester. J Am Chem Soc. 130(24):7554-5.
- Li Y, Roux C, Lazereg S, LeCaer JP, Laprévote O, Badet B, Badet-Denisot MA. (2007) Identification of a novel serine phosphorylation site in human glutamine: fructose-6-phosphate amidotransferase isoform 1. Biochemistry. 46(45):13163-9.
- Llewellyn NM, Li Y, Spencer JB. (2007) Biosynthesis of butirosin: transfer and deprotection of the unique amino acid side chain. Chem Biol. 14(4):379-86.
- Li Y, Llewellyn NM, Giri R, Huang F, Spencer JB. (2005) Biosynthesis of the unique amino acid side chain of butirosin: possible protective-group chemistry in an acyl carrier protein-mediated pathway. Chem Biol. 12(6):665-75.
Publications
2022
- 2022 — Crystal structure of BtrK, a decarboxylase involved in the (S)-4-amino-2-hydroxybutyrate (AHBA) formation during butirosin biosynthesis. Journal of Molecular Structure. Vol. 1267, p. 133576.,ISSN:0022-2860
- 2022 — Structure of Lacticaseicin 30 and Its Engineered Variants Revealed an Interplay between the N-Terminal and C-Terminal Regions in the Activity against Gram-Negative Bacteria. Pharmaceutics. Vol. 14, n° 9, p. 1921.,ISSN:1999-4923
2021
- 2021 — Towards the sustainable discovery and development of new antibiotics. Nature Reviews Chemistry. Vol. 5, p. 726-749.,ISSN:2397-3358
2020
- Avril 2020 — Opposite effect of vancomycin and D-Cycloserine combination in both vancomycin resistant Staphylococcus aureus and enterococci. FEMS microbiology letters. Vol. 367, n° 8.,ISSN:1574-6968
- 2020 — Unbiased libraries in protein directed evolution. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics. Vol. 1868, n° 2, p. 140321.,ISSN:1570-9639
- 2020 — The manifold roles of microbial ribosomal peptide-based natural products in physiology and ecology. The Journal of Biological Chemistry. Vol. 295, n° 1, p. 34-54.,ISSN:1083-351X
- 2020 — Rich Repertoire of Quorum Sensing Protein Coding Sequences in CPR and DPANN Associated with Interspecies and Interkingdom Communication. mSystems. Vol. 5, n° 5, e00414--20.,ISSN:2379-5077
- 2020 — Beyond arbitrium: identification of a second communication system in Bacillus phage phi3T that may regulate host defense mechanisms. The ISME Journal. Publisher: Nature Publishing Group.,ISSN:1751-7370
2019
- Mars 2019 — Azetidine-Containing Alkaloids Produced by a Quorum-Sensing Regulated Nonribosomal Peptide Synthetase Pathway in Pseudomonas aeruginosa. Angewandte Chemie International Edition. Vol. 58, n° 10, p. 3178-3182.,ISSN:14337851
- 2019 — A Ugi Straightforward Access to Bis-β-lactam Derivatives. European Journal of Organic Chemistry. Vol. 2019, n° 27, p. 4457-4463.,ISSN:1099-0690