MCAM est un laboratoire sous la double tutelle du CNRS (INEE,INC) et du Muséum national d'Histoire naturelle.
Sébastien DUPERRON
Sébastien DUPERRON
Professeur(e)
Chargé(e) d’enseignement
Entité de rattachement
CCE Cyanobactéries, cyanotoxines et environnement
Thème interdisciplinaire de recherche
Ecotoxicologie microbienne, interactions
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Contact
Réseaux sociaux
Site(s) internet
Courriel
Téléphone
01 40 79 31 26
Adresse(s)
12 rue Buffon
75005 Paris
Responsabilités hors unité
Responsabilités collectives :
- Membre Junior de l’Institut Universitaire de France
- Membre élu du CA de l’UFR 927 Sciences de la Vie (UPMC, 2013-2017)
- Représentant UPMC à la direction de l’ED 227 (2016-2017)
- Membre suppléant du CNU section 68 rang B (2015-2017)
- Chargé de Mission UPMC, Coordination du pôle 3 Terre vivante et environnement (2013-2017)
- Jury de thèses et HDRs
Responsabilités éditoriales :
- Editeur académique « Symbiosis »
- Editeur académique « PloS One »
- Editeur associé « Frontiers in Microbial Symbioses »
- Editeur invité « Marine Environmental Research » numéro spécial
- Reviewer pour plus de 20 journaux internationaux, projets nationaux et internationaux, campagnes océanographiques
Projets de recherche :
- Porteur et participant dans divers projets de recherche (ANR, SU, financements régionaux, ATM, projets européens FP et ITN)
Enseignement(s)
- Enseignement en Master à l’UPMC (maître de conférence UPMC de 2005 à 2017) et au MNHN (professeur depuis 2017) sur les thèmes symbioses, milieux extrêmes, océan profond, écologie microbienne
- Enseignement en Licence à l’UPMC sur les thèmes biologie animale et végétale, écologie marine, écologie microbienne, méthodologie
- Responsable de l’Unité d’Enseignement de Master 2 « Biologie et Adaptation en Milieux Extrêmes » 5BM08, UPMC, avec J. Ravaux (MC UPMC)
- Responsable élu de la division d’enseignement de Biologie animale à l’UPMC, 2014-2017
- Responsable de l’Unité d’Enseignement de Licence 3 « Biologie comparée et évolution des animaux » 3V612, UPMC avec S. Debernard (MC UPMC) et A. Quilhac (MC UPMC), 2011-2017
Activités de recherche
Approches intégrées des symbioses entre bactéries et animaux :
J’étudie la diversité, le fonctionnement et l’évolution des symbioses unissant bactéries et métazoaires et contribuant à l’adaptation des holobiontes à leur environnement. Ma recherche aborde des aspects de biologie animale (altération des tissus par la symbiose, modes de transmission et cycle de vie, contribution à la nutrition, impact sur la biologie des espèces) et des aspects d’écologie microbienne (caractérisation des partenaires bactériens et de leur métabolisme, étude des bactéries dans l’environnement, rôles dans l’adaptation). Une partie du travail que j’ai mené avant mon arrivée à MCAM a porté sur les symbioses entre bactéries chimiotrophes et animaux (mollusques et annélides) dans les environnements marins réduits (sources hydrothermales sous marines, suintements froids, bois coulés). Je développe actuellement l’étude de l’impact de contaminants d’origine anthropique ou non sur la composition des microbiotes associés aux animaux dans des milieux continentaux (lacs, étangs…) et lors d’expériences d’expositions contrôlées.
Effet des contaminants sur les communautés microbiennes dans des plans d’eau en milieu périurbain :
Un autre volet de ma recherche porte sur les communautés microbiennes (bactéries, archées et protistes) présentes dans des plans d’eau périurbains ou non. Le but est de comprendre le rôle de facteurs biotiques et abiotiques dans la structuration de ces communautés communautés à l’échelle régionale (chantier sur l’Ile de France), ainsi que leur dynamique temporelle. Parmi les facteurs considérés je porte un intérêt particulier à l’effet de contaminants qui représentent un danger pour les utilisateurs des plans d’eau (cyanotoxines, métaux, pesticides ou perturbateurs endocriniens), ainsi qu’au rôle des communautés microbiennes dans le contrôle de ces contaminants et comme bioindicateurs de la qualité des eaux.
Publications
2022
- , Décembre 2022 — Metagenome-Based Exploration of Bacterial Communities Associated with Cyanobacteria Strains Isolated from Thermal Muds. Cyanobacteria constitute a pioneer colonizer of specific environments for whom settlement in new biotopes precedes the... Microorganisms. Vol. 10, n° 12, p. 2337. Number: 12 Publisher: Multidisciplinary Digital Publishing Institute.ISSN:2076-2607
- , Novembre 2022 — Establishment of the Bacterial Microbiota in a Lab-Reared Model Teleost Fish, the Medaka Oryzias latipes. Oryzias latipes is an important model organism for physiology, genetics, and developmental studies, and has also emerged as a... Microorganisms. Vol. 10, n° 11, p. 2280. Number: 11 Publisher: Multidisciplinary Digital Publishing Institute.ISSN:2076-2607
- , Octobre 2022 — Gut microbiota and holobiont metabolome composition of the Medaka fish (Oryzias latipes) are affected by a short exposure to the cyanobacterium Microcystis aeruginosa. Blooms of toxic cyanobacteria are a common stress encountered by aquatic fauna. Evidence indicates that long-lasting blooms... Aquatic Toxicology. P. 106329.ISSN:0166-445X
- , Octobre 2022 — Computational Metabolomics Tools Reveal Subarmigerides, Unprecedented Linear Peptides from the Marine Sponge Holobiont Callyspongia subarmigera. A detailed examination of a unique molecular family, restricted to the Callyspongia genus, in a molecular network obtained from... Marine Drugs. Vol. 20, n° 11, p. 673.ISSN:1660-3397
- , Septembre 2022 — “There and back again” - Ultrastructural changes in the gills of Bathymodiolus vent-mussels during symbiont loss: Back to a regular filter-feeding epidermis. Deep-sea mussels Bathymodiolus azoricus , from Azorean hydrothermal vents, house two types of symbionts in their fleshy gills:... Frontiers in Marine Science. Vol. 9, p. 968331.ISSN:2296-7745
- , 2022 — The culture collection of cyanobacteria and microalgae at the French National Museum of Natural History: a century old but still alive and kicking ! Including in memoriam: Professor Alain Couté. Cyanobacteria and eukaryotic microalgae are key players in life on Earth. They have adapted to a broad diversity of ecosystems... Cryptogamie, Algologie. Vol. 43, n° 3, p. 41-83.ISSN:0181-1568
- , 2022 — Fish gut-associated bacterial communities in a tropical lagoon (Aghien lagoon, Ivory Coast). Aghien lagoon (Ivory Coast) is a eutrophic freshwater lagoon that harbors high biomasses of phytoplankton. Despite Increasing... Frontiers in Microbiology. Vol. 13.ISSN:1664-302X
2021
- , Décembre 2021 — Investigation of Capitella spp. symbionts in the context of varying anthropic pressures: First occurrence of a transient advantageous epibiosis with the giant bacteria Thiomargarita sp. to survive seasonal increases of sulfides in sediments. Capitella spp. is considered as an important ecological indicator of eutrophication due to its high densities in organic-rich,... Science of The Total Environment. Vol. 798, p. 149149.ISSN:0048-9697
- , Septembre 2021 — Bacterial ectosymbionts colonizing gills of two Caribbean mangrove crabs. We describe here the interactions between bacterial ectosymbionts and two Caribbean mangrove crabs: Aratus pisonii (Sesarmidae... Symbiosis. Vol. 85, n° 1, p. 105-114.ISSN:0334-5114, 1878-7665
- , Juin 2021 — Endozoicomonadaceae symbiont in gills of Acesta clam encodes genes for essential nutrients and polysaccharide degradation. Gammaproteobacteria from the family Endozoicomonadaceae have emerged as widespread associates of dense marine animal... FEMS Microbiology Ecology. Vol. 97, n° 6, fiab070.ISSN:0168-6496