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CCE Cyanobacteria, Cyanotoxins and Environment
Interdisplinary research theme
Ecotoxicologie microbienne, interactions
Researches
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sebastien.duperron [at] mnhn.fr
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01 40 79 31 26
Address(es)

12 rue Buffon

75005 Paris

Responsibilities outside unit

Responsabilités collectives :

  • Membre Junior de l’Institut Universitaire de France
  • Membre élu du CA de l’UFR 927 Sciences de la Vie (UPMC, 2013-2017)
  • Représentant UPMC à la direction de l’ED 227 (2016-2017)
  • Membre suppléant du CNU section 68 rang B (2015-2017)
  • Chargé de Mission UPMC, Coordination du pôle 3 Terre vivante et environnement (2013-2017)
  • Jury de thèses et HDRs



Responsabilités éditoriales :

  • Editeur académique « Symbiosis »
  • Editeur académique « PloS One »
  • Editeur associé « Frontiers in Microbial Symbioses »
  • Editeur invité « Marine Environmental Research » numéro spécial
  • Reviewer pour plus de 20 journaux internationaux, projets nationaux et internationaux, campagnes océanographiques

 

Projets de recherche :

  • Porteur et participant dans divers projets de recherche (ANR, SU, financements régionaux, ATM, projets européens FP et ITN)

Teaching

Presentation

Activités de recherche

Approches intégrées des symbioses entre bactéries et animaux :

J’étudie la diversité, le fonctionnement et l’évolution des symbioses unissant bactéries et métazoaires et contribuant à l’adaptation des holobiontes à leur environnement. Ma recherche aborde des aspects de biologie animale (altération des tissus par la symbiose, modes de transmission et cycle de vie, contribution à la nutrition, impact sur la biologie des espèces) et des aspects d’écologie microbienne (caractérisation des partenaires bactériens et de leur métabolisme, étude des bactéries dans l’environnement, rôles dans l’adaptation). Une partie du travail que j’ai mené avant mon arrivée à MCAM a porté sur les symbioses entre bactéries chimiotrophes et animaux (mollusques et annélides) dans les environnements marins réduits (sources hydrothermales sous marines, suintements froids, bois coulés). Je développe actuellement l’étude de l’impact de contaminants d’origine anthropique ou non sur la composition des microbiotes associés aux animaux dans des milieux continentaux (lacs, étangs…) et lors d’expériences d’expositions contrôlées.



Effet des contaminants sur les communautés microbiennes dans des plans d’eau en milieu périurbain :

Un autre volet de ma recherche porte sur les communautés microbiennes (bactéries, archées et protistes) présentes dans des plans d’eau périurbains ou non. Le but est de comprendre le rôle de facteurs biotiques et abiotiques dans la structuration de ces communautés communautés à l’échelle régionale (chantier sur l’Ile de France), ainsi que leur dynamique temporelle. Parmi les facteurs considérés je porte un intérêt particulier à l’effet de contaminants qui représentent un danger pour les utilisateurs des plans d’eau (cyanotoxines, métaux, pesticides ou perturbateurs endocriniens), ainsi qu’au rôle des communautés microbiennes dans le contrôle de ces contaminants et comme bioindicateurs de la qualité des eaux.

Publications

2024
  • Halary Sébastien, Duval Charlotte, Marie Benjamin, Bernard Cécile, Piquet Bérénice, Gros Olivier, Bourguet-Kondracki Marie-Lise & Duperron Sébastien, 2024Genomes of nine biofilm-forming filamentous strains of Cyanobacteria (genera Jaaginema, Scytonema, and Karukerafilum gen. nov.) isolated from mangrove habitats of Guadeloupe (Lesser Antilles). FEMS Microbes vol. 5, , xtad024
    ISSN
    2633-6685
2023
  • Duperron Sébastien, Foucault Pierre, Duval Charlotte, Goto Midoli, Gallet Alison, Colas Simon & Marie Benjamin, November 2023Multi-omics analyses from a single sample: prior metabolite extraction does not alter the 16S rRNA-based characterization of prokaryotic community in a diversity of sample types. Massive sequencing of the 16S rRNA gene has become a standard first step to describe and compare microbial communities from… FEMS Microbiology Letters , , fnad125
    ISSN
    0378-1097
  • Bruto Maxime, Oger Philippe M., Got Patrice, Bernard Cécile, Melayah Delphine, Cloarec Lilian A., Duval Charlotte, Escalas Arthur, Duperron Sébastien, Guigard Ludivine, Leboulanger Christophe, Ader Magali, Sarazin Gerard, Jézéquel Didier, Agogué Hélène et al., October 2023Phytoplanktonic species in the haloalkaline Lake Dziani Dzaha select their archaeal microbiome. Microorganisms are key contributors of aquatic biogeochemical cycles but their microscale ecology remains largely unexplored,… Molecular Ecology , ,
    ISSN
    1365-294X
  • Halary Sébastien, Duperron Sébastien, Kim Tiam Sandra, Duval Charlotte, Bernard Cécile & Marie Benjamin, June 2023Intra-population genomic diversity of the bloom-forming cyanobacterium, Aphanizomenon gracile, at low spatial scale. Cyanobacteria are oxygenic photosynthetic bacteria that perform a substantial part of the global primary production. Some… ISME Communications vol. 3, n° 1, p. 1-4 Number: 1 Publisher: Nature Publishing Group
    ISSN
    2730-6151
  • Gallet Alison, Halary Sébastien, Duval Charlotte, Huet Hélène, Duperron Sébastien & Marie Benjamin, May 2023Disruption of fish gut microbiota composition and holobiont’s metabolome during a simulated Microcystis aeruginosa (Cyanobacteria) bloom. Cyanobacterial blooms are one of the most common stressors encountered by metazoans living in freshwater lentic systems such as… Microbiome vol. 11, n° 1, p. 108
    ISSN
    2049-2618
  • Wang Huibin, Halary Sébastien, Duval Charlotte, Bernard Cécile, Troussellier Marc, Beniddir Mehdi A., Brunel Jean-Michel, Castaldi Andrea, Caudal Flore, Golléty Claire, Martin Coralie, Bourguet-Kondracki Marie-Lise & Duperron Sébastien, 2023Diversity, metabolome profiling and bioactivities of benthic filamentous cyanobacteria isolated from coastal mangroves of Mayotte. Frontiers in Marine Science vol. 10, ,
    ISSN
    2296-7745
  • Massé Anaïs, Detang Juliette, Duval Charlotte, Duperron Sébastien, Woo Anthony C. & Domart-Coulon Isabelle, 2023Bacterial Microbiota of Ostreobium, the Coral-Isolated Chlorophyte Ectosymbiont, at Contrasted Salinities. Microorganisms vol. 11, n° 5, p. 1318
    ISSN
    2076-2607
2022
  • Halary Sébastien, Duperron Sébastien, Demay Justine, Duval Charlotte, Hamlaoui Sahima, Piquet Bérénice, Reinhardt Anita, Bernard Cécile & Marie Benjamin, December 2022Metagenome-Based Exploration of Bacterial Communities Associated with Cyanobacteria Strains Isolated from Thermal Muds. Cyanobacteria constitute a pioneer colonizer of specific environments for whom settlement in new biotopes precedes the… Microorganisms vol. 10, n° 12, p. 2337 Number: 12 Publisher: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
    ISSN
    2076-2607
  • Duval Charlotte, Marie Benjamin, Foucault Pierre & Duperron Sébastien, November 2022Establishment of the Bacterial Microbiota in a Lab-Reared Model Teleost Fish, the Medaka Oryzias latipes. Oryzias latipes is an important model organism for physiology, genetics, and developmental studies, and has also emerged as a… Microorganisms vol. 10, n° 11, p. 2280 Number: 11 Publisher: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
    ISSN
    2076-2607
  • Foucault Pierre, Gallet Alison, Duval Charlotte, Marie Benjamin & Duperron Sébastien, October 2022Gut microbiota and holobiont metabolome composition of the Medaka fish (Oryzias latipes) are affected by a short exposure to the cyanobacterium Microcystis aeruginosa. Blooms of toxic cyanobacteria are a common stress encountered by aquatic fauna. Evidence indicates that long-lasting blooms… Aquatic Toxicology , , p. 106329
    ISSN
    0166-445X