Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Processus d'adhésion des diatomées : vers l’élucidation de mécanismes moléculaires
Spécialité
Adhésion, Diatomée, Transcriptomique, Métabolomique, Statistiques multivariées, Antifouling

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Présentation

Activités de recherche

Les diatomées sont, avec les bactéries, les premiers organismes à coloniser les structures immergées engendrant des problèmes de salissure (ou fouling). Les derniers travaux sur le design de nouveaux antifoulings non-toxiques se basent sur des stratégies qui modifient les revêtements. Notre approche, en rupture avec ces précédentes études, propose de déterminer si les diatomées disposeraient de mécanisme d’adhésion s’adaptant au substrat rencontré.

 

Notre projet s’attachera à mettre en évidence de potentielles variabilités du métabolome des diatomées Phaeodactylum tricornutum, Cylindrotheca closterium et Amphora coffaeformis, en fonction de leur capacité d’adhésion sur trois substrats différents (verre, polystyrène, polydimethylsiloxane). Deux approches complémentaires seront développées qui utilisent les méthodes modernes et innovantes que sont la génétique avec des analyses transcriptomiques et la métabolomique (spectrométrie de masse, résonnance magnétique nucléaire et modélisations de statistiques multivariée) avec l’étude des réseaux moléculaires, afin d'identifier respectivement les gènes et les molécules produites sur des revêtements spécifiques.

 

Ces travaux permettront de décrire et comprendre les mécanismes moléculaires de l’adhésion des diatomées, de définir les caractères des surfaces antifouling, de connaître les métabolites impliqués dans les phénomènes adhésifs. Cette étude participera à l’innovation dans le design de matériaux antifoulings en tenant compte de la réalité du processus d’adhésion des diatomées.

Publications

2023
  • Wang Huibin, Halary Sébastien, Duval Charlotte, Bernard Cécile, Troussellier Marc, Beniddir Mehdi A., Brunel Jean-Michel, Castaldi Andrea, Caudal Flore, Golléty Claire, Martin Coralie, Bourguet-Kondracki Marie-Lise & Duperron Sébastien, 2023Diversity, metabolome profiling and bioactivities of benthic filamentous cyanobacteria isolated from coastal mangroves of Mayotte. Frontiers in Marine Science vol. 10, ,
    ISSN
    2296-7745
2022
  • Castaldi Andrea, Teta Roberta, Esposito Germana, Beniddir Mehdi A., De Voogd Nicole J., Duperron Sébastien, Costantino Valeria & Bourguet-Kondracki Marie-Lise, 2022Computational Metabolomics Tools Reveal Subarmigerides, Unprecedented Linear Peptides from the Marine Sponge Holobiont Callyspongia subarmigera. Marine Drugs vol. 20, n° 11, p. 673
    ISSN
    1660-3397