Liste des publications

Audemard Juliette, Creusot Nicolas, Leloup Julie, Duval Charlotte, Halary Sbastien, Mary Lou, Eon Melissa, et al. 2026. « Integrating metagenome-scale metabolic models and metabolomics to explore candidate biochemical interactions in cultivated Microcystis phycospheres ». ISME Communications, août, ycag226. doi:10.1093/ismeco/ycag226.

Duperron Sébastien, Foucault Pierre, Vern Amaury Le, Goto Midoli, Duval Charlotte, Marie Benjamin, Hamlaoui Sahima, et al. 2026. « Higher Trophic Status Leads to More Diverse and Divergent Microeukaryote Communities Over Time in Urban Lakes From the Greater Paris (France) ». Environmental Microbiology Reports 18 (juin): e70355. doi:10.1111/1758-2229.70355.

Roussel Théotime, Quiquand Manon, Duval Charlotte, Cadoret Jean-Paul, Yéprémian Claude, Le Vern Amaury, Marie Benjamin, et Bernard Cécile. 2026. « Efficient selection of new Limnospira platensis strains (spirulina) for biomass and high-value molecule production ». Journal of Applied Phycology, mai. doi:10.1007/s10811-026-03866-0.

Le Meur Maiwenn, Decaestecker Ellen, Chang Xuexiu, Marie Benjamin, et Duperron Sébastien. 2026. « From bystander to key player: unveiling the gut microbiota’s role in mediating cyanobacterial toxicity in aquatic animals ». FEMS Microbiology Ecology 102 (mars): fiag017. doi:10.1093/femsec/fiag017.

Noirmain Fanny, Marie Benjamin, Legrand Benjamin, et Latour Delphine. 2026. « Drought preceding rain events drives shifts in phytoplankton composition and metabolome in Lake Aydat (France) revealing molecular strategies ». FEMS microbiology ecology 102 (février): fiag015. doi:10.1093/femsec/fiag015.

Huré Aurore, Le Meur Maiwenn, Duval Charlotte, Bouly Jean-Pierre, Mary Lou, Quiquand Manon, Dawra Michella, Gugger Muriel, Halary Sébastien, et Marie Benjamin. 2026. « Metabolite diversity of Microcystis strains shows tight correspondence to genotype and may contribute to ecotype specificities ». Communications Biology 9 (janvier). Nature Publishing Group: 305. doi:10.1038/s42003-026-09599-7.

Marie Benjamin, Le Meur Maiwenn, Duval Charlotte, Quiquand Manon, Lance Emilie, et Duperron Sébastien. 2025. « The threat is in the details - critical gap in ecotoxicological assessment of Microcystis blooms revealed by critical distinctions of genotype effects induced on Medaka fish ». Environmental Pollution (Barking, Essex: 1987), novembre, 127344. doi:10.1016/j.envpol.2025.127344.

Foucault Pierre, Halary Sébastien, Duval Charlotte, Goto Midoli, Marie Benjamin, Hamlaoui Sahima, Jardillier Ludwig, et al. 2025. « A summer in the greater Paris: trophic status of peri-urban lakes shapes prokaryotic community structure and functional potential ». Environmental Microbiome 20 (février): 24. doi:10.1186/s40793-025-00681-x.

Roussel Théotime, Hubas Cédric, Halary Sébastien, Chynel Mathias, Duval Charlotte, Cadoret Jean-Paul, Meziane Tarik, et al. 2025. « Limnospira (Cyanobacteria) chemical fingerprint reveals local molecular adaptation ». Microbiology Spectrum, janvier, e01901–24. doi:10.1128/spectrum.01901-24.

Touceda Inés Seijo, Demay Justine, Duval Charlotte, Yéprémian Claude, Reinhardt Anita, et Marie Benjamin. 2024. « Light and temperature culture conditions impact the metabolome of the cyanobacterium of therapeutic interest Planktothricoides raciborskii PMC 877.14 ». Algal Research 84 (décembre): 103738. doi:10.1016/j.algal.2024.103738.

Colas Simon, Marie Benjamin, Morin Soizic, Milhe-Poutingon Mathieu, Foucault Pierre, Chalvin Siann, Gelber Clémentine, et al. 2024. « New sensitive tools to characterize meta-metabolome response to short- and long-term cobalt exposure in dynamic river biofilm communities ». Science of The Total Environment 927 (juin): 171851. doi:10.1016/j.scitotenv.2024.171851.

Colas Simon, Marie Benjamin, Milhe-Poutingon Mathieu, Lot Marie-Claire, Boullemant Amiel, Fortin Claude, et Le Faucheur Séverine. 2024. « Meta-metabolomic responses of river biofilms to cobalt exposure and use of dose-response model trends as an indicator of effects ». Journal of Hazardous Materials 470 (mai): 134099. doi:10.1016/j.jhazmat.2024.134099.

Halary Sébastien, Duval Charlotte, Marie Benjamin, Bernard Cécile, Piquet Bérénice, Gros Olivier, Bourguet-Kondracki Marie-Lise, et Duperron Sébastien. 2024. « Genomes of nine biofilm-forming filamentous strains of Cyanobacteria (genera Jaaginema, Scytonema, and Karukerafilum gen. nov.) isolated from mangrove habitats of Guadeloupe (Lesser Antilles) ». FEMS Microbes 5 (janvier): xtad024. doi:10.1093/femsmc/xtad024.

Duperron Sébastien, Foucault Pierre, Duval Charlotte, Goto Midoli, Gallet Alison, Colas Simon, et Marie Benjamin. 2023. « Multi-omics analyses from a single sample: prior metabolite extraction does not alter the 16S rRNA-based characterization of prokaryotic community in a diversity of sample types ». FEMS Microbiology Letters, novembre, fnad125. doi:10.1093/femsle/fnad125.

Roussel Théotime, Halary Sébastien, Duval Charlotte, Piquet Bérénice, Cadoret Jean-Paul, Vernès Léa, Bernard Cécile, et Marie Benjamin. 2023. « Monospecific renaming within the cyanobacterial genus Limnospira (Spirulina) and consequences for food authorization ». Journal of Applied Microbiology 134 (août): lxad159. doi:10.1093/jambio/lxad159.

Halary Sébastien, Duperron Sébastien, Kim Tiam Sandra, Duval Charlotte, Bernard Cécile, et Marie Benjamin. 2023. « Intra-population genomic diversity of the bloom-forming cyanobacterium, Aphanizomenon gracile, at low spatial scale ». ISME Communications 3 (juin): 1–4. doi:10.1038/s43705-023-00263-3.

Gallet Alison, Halary Sébastien, Duval Charlotte, Huet Hélène, Duperron Sébastien, et Marie Benjamin. 2023. « Disruption of fish gut microbiota composition and holobiont’s metabolome during a simulated Microcystis aeruginosa (Cyanobacteria) bloom ». Microbiome 11 (mai): 108. doi:10.1186/s40168-023-01558-2.

Halary Sébastien, Duperron Sébastien, Demay Justine, Duval Charlotte, Hamlaoui Sahima, Piquet Bérénice, Reinhardt Anita, Bernard Cécile, et Marie Benjamin. 2022. « Metagenome-Based Exploration of Bacterial Communities Associated with Cyanobacteria Strains Isolated from Thermal Muds ». Microorganisms 10 (décembre): 2337. doi:10.3390/microorganisms10122337.

Gaëtan Juliette, Halary Sébastien, Millet Maxime, Bernard Cécile, Duval Charlotte, Hamlaoui Sahima, Hecquet Amandine, et al. 2022. « Widespread formation of intracellular calcium carbonates by the bloom-forming cyanobacterium Microcystis ». Environmental Microbiology, décembre. doi:10.1111/1462-2920.16322.

Duval Charlotte, Marie Benjamin, Foucault Pierre, et Duperron Sébastien. 2022. « Establishment of the Bacterial Microbiota in a Lab-Reared Model Teleost Fish, the Medaka Oryzias latipes ». Microorganisms 10 (novembre): 2280. doi:10.3390/microorganisms10112280.