Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Biochimie des protéines; Biochimie structurale; Analyse structurale (Spectrométrie de masse, RMN); Microbiologie
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Spécialité
Peptides antimicrobiens; Bactériocines, Microcines, Halocines; Modifications post-traductionnelles; Mécanismes d'action; Mécanismes de biosynthèse; Microbiote

Contact

Courriel
sylvie.rebuffat [at] mnhn.fr
Téléphone
01 40 79 31 18
Adresse(s)

43 rue Buffon

24 allée des crapauds

75005 Paris

Responsabilités dans l'unité

Responsabilités antérieures

  • Directeur du Laboratoire Molécules de Communication et Adaptation des Microorganismes (MCAM), UMR 7245 CNRS-MNHN (2007-2016)
  • Directeur de l'équipe Molécules de défense et de communication dans les écosystèmes microbiens (MDCEM) (2007-2013)

Responsabilités hors unité

Activités actuelles

  • Membre du Comité Scientifique de l’Ifremer (2014-2019; renouvelé en 2020).
  • Membre de comités de visite d’unités de recherche pour le HCERES (Haut Conseil de l'Evaluation de la Recherche et de l'Enseignement Supérieur) 2021
  • Professeur associé à l’Université Laval, Québec, Canada (depuis octobre 2017)
  • Membre du Comité éditorial de la revue scientifique Applied and Environmental Microbiology (depuis 2020 ; renouvellé en 2022).
  • Membre du Comité éditorial de la revue scientifique Frontiers in Nutrition- Section Nutrition and and Microbes (depuis 2020).
  • Membre du comité éditorial de la revue scientifique Frontiers in Microbiology- Section Antimicrobialq, resistance and chemotherapy (depuis 2022).

Responsabilités antérieures

  • Directeur de la Recherche, de l'Expertise et de la Valorisation du MNHN (Direction de la Recherche, de l'Expertise et de la Valorisation, DiREV) (2011-2016)

Enseignements

Présentation

Activités de recherche

Les recherches sont centrées sur les aspects moléculaires des processus adaptatifs et des mécanismes de défense des bactéries. Les peptides antimicrobiens produits par les bactéries (que l’on nomme microcines et bactériocines) sont isolés, purifiés et caractérisés sur le plan biochimique et structural pour décrypter les mécanismes moléculaires impliqués dans la reconnaissance de ces peptides par des récepteurs membranaires spécifiques et leurs interactions avec des cibles intracellulaires chez les bactéries sensibles. Certaines microcines et bactériocines portent des modifications posttraductionnelles. Elles font alors partie de la famille des peptides ribosomaux modifiés posttraductionnellement (ribosomally synthesized and posttranslationally modified peptides, RiPPs), actuellement en pleine expansion. Les mécanismes de leur biosynthèse, assurée par des enzymes impliquées dans la maturation de leurs précurseurs protéiques et la mise en place des modifications post-traductionnelles pour conduire aux peptides matures actifs, sont étudiés. Le rôle écologique de ces peptides antimicrobiens est abordé, en particulier leur implication dans les compétitions microbiennes au sein de différents microbiotes, comme le microbiote intestinal, en vue d’applications en médecine humaine ou vétérinaire.

Proceedings

Identification of Lasso and Branched-Cyclic Topoisomers Using Trapped Ion Mobility Spectrometry – Mass Spectrometry and Ion Spectroscopy
K Jeanne Dit Fouque1; J D. Hegemann2; S Zirah3; S Rebuffat3; P Maitre4; F Fernandez-Lima1
Proceedings 65th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics 2018 (San Diego CA, USA, 3-7 juin 2018)

Brevets

Dérivés de la purine pour leur utilisation dans le traitement ou la prévention de maladies dues à une mutation non-sens
S. Amand, F. Lejeune, C. Maulay-Bailly, S. Rebuffat
FR1660244, dépôt le 21.10.2016.
PCT/EP2017/076846, dépôt le 20.10.2017.
 
Lepista flaccida destiné à être utilisé dans le traitement d’une maladie due à une mutation non-sens
S. Amand, F. Lejeune, C. Maulay-Bailly, S. Rebuffat
FR1660229, dépôt le 21.10.2016
PCT/EP2017/076848, dépôt le 20.10.2017.

Publications

2024
  • Baquero Fernando, Beis Konstantinos, Craik David J., Li Yanyan, Link A. James, Rebuffat Sylvie, Salomón Raúl, Severinov Konstantin, Zirah Séverine & Hegemann Julian D., 2024The pearl jubilee of microcin J25: thirty years of research on an exceptional lasso peptide. Natural Product Reports , ,
    ISSN
    1460-4752
2023
  • Leroy Catherine, Spelier Sacha, Essonghe Nadège Charlene, Poix Virginie, Kong Rebekah, Gizzi Patrick, Bourban Claire, Amand Séverine, Bailly Christine, Guilbert Romain, Hannebique David, Persoons Philippe, Arhant Gwenaëlle, Prévotat Anne, Reix Philippe et al., 2023Use of 2,6-diaminopurine as a potent suppressor of UGA premature stop codons in cystic fibrosis. Molecular Therapy vol. 31, , p. 970-985
    ISSN
    1525-0016
2022
  • Madi-Moussa Désiré, Deracinois Barbara, Teiar Radja, Li Yanyan, Mihasan Marius, Flahaut Christophe, Rebuffat Sylvie, Coucheney Françoise & Drider Djamel, 2022Structure of Lacticaseicin 30 and Its Engineered Variants Revealed an Interplay between the N-Terminal and C-Terminal Regions in the Activity against Gram-Negative Bacteria. Pharmaceutics vol. 14, n° 9, p. 1921
    ISSN
    1999-4923
  • Naimi Sabrine, Zirah Séverine, Greppi Anna, Lacroix Christophe, Rebuffat Sylvie & Fliss Ismail, 2022Impact of microcin J25 on the porcine microbiome in a continuous culture model. Frontiers in Microbiology vol. 13, , p. 930392
    ISSN
    1664-302X
  • Rebuffat Sylvie, 2022Ribosomally synthesized peptides, foreground players in microbial interactions: recent developments and unanswered questions. Natural Product Reports vol. 39, n° 2, p. 273-310
    ISSN
    1460-4752
  • Soltani Samira, Zirah Séverine, Rebuffat Sylvie, Couture Frédéric, Boutin Yvan, Biron Eric, Subirade Muriel & Fliss Ismail, 2022Gastrointestinal Stability and Cytotoxicity of Bacteriocins From Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria: A Comparative in vitro Study. Frontiers in Microbiology vol. 12, , p. 780355
    ISSN
    1664-302X
2021
  • Dit Fouque Kevin Jeanne, Scutelnic Valeriu, Hegemann Julian D., Rebuffat Sylvie, Maître Philippe, Rizzo Thomas R. & Fernandez-Lima Francisco, 2021Structural Insights from Tandem Mass Spectrometry, Ion Mobility-Mass Spectrometry, and Infrared/Ultraviolet Spectroscopy on Sphingonodin I: Lasso vs Branched-Cyclic Topoisomers. Journal of the American Society for Mass Spectrometry vol. 32, n° 4, p. 1096-1104
    ISSN
    1044-0305
  • Ghilarov Dmitry, Inaba-Inoue Satomi, Stepien Piotr, Qu Feng, Michalczyk Elizabeth, Pakosz Zuzanna, Nomura Norimichi, Ogasawara Satoshi, Walker Graham Charles, Rebuffat Sylvie, Iwata So, Heddle Jonathan Gardiner & Beis Konstantinos, 2021Molecular mechanism of SbmA, a promiscuous transporter exploited by antimicrobial peptides. Science Advances vol. 7, n° 37, eabj5363
  • Montalbán-López Manuel, A. Scott Thomas, Ramesh Sangeetha, R. Rahman Imran, Heel Auke J. van, H. Viel Jakob, Bandarian Vahe, Dittmann Elke, Genilloud Olga, Goto Yuki, Burgos María José Grande, Hill Colin, Kim Seokhee, Koehnke Jesko, A. Latham John et al., 2021New developments in RiPP discovery, enzymology and engineering. Natural Product Reports vol. 38, n° 1, p. 130-239
    ISSN
    0265-0568, 1460-4752
  • Soltani Samira, Hammami Riadh, Cotter Paul D, Rebuffat Sylvie, Said Laila Ben, Gaudreau Hélène, Bédard François, Biron Eric, Drider Djamel & Fliss Ismail, 2021Bacteriocins as a new generation of antimicrobials: toxicity aspects and regulations. FEMS Microbiology Reviews vol. 45, n° 1,
    ISSN
    0168-6445