MCAM est un laboratoire sous la double tutelle du CNRS (INEE,INC) et du Muséum national d'Histoire naturelle.
Sylvie REBUFFAT
Sylvie REBUFFAT
Professeur(e)
Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Biochimie des protéines; Biochimie structurale; Analyse structurale (Spectrométrie de masse, RMN); Microbiologie
Spécialité
Peptides antimicrobiens; Bactériocines, Microcines, Halocines; Modifications post-traductionnelles; Mécanismes d'action; Mécanismes de biosynthèse; Microbiote
Contact
Responsabilités dans l'unité
Responsabilités antérieures
- Directeur du Laboratoire Molécules de Communication et Adaptation des Microorganismes (MCAM), UMR 7245 CNRS-MNHN (2007-2016)
- Directeur de l'équipe Molécules de défense et de communication dans les écosystèmes microbiens (MDCEM) (2007-2013)
Responsabilités hors unité
Activités actuelles
- Chargé de mission au CNRS, Institut Ecologie et Environnement (INEE) depuis 2009. Responsable du partenariat entre l'INEE et le Muséum: DiPEE du Muséum (Dispositif de Partenariat en écologie et environnement).
- Chargé de mission à la Direction générale déléguée à la Recherche, l'Expertise, la Valorisation et l'Enseignement du Muséum (DGD-REVE).
- Coordinateur du dossier d'évaluation du Muséum par le Haut Conseil de l'Evaluation de la Recherche et de l'Enseignement Supérieur (HCéRES).
- Chargé du suivi des unités de recherche du MNHN (16 UMR, 4 UMS).
Responsabilités antérieures
- Directeur de la Recherche, de l'Expertise et de la Valorisation du MNHN (Direction de la Recherche, de l'Expertise et de la Valorisation, DiREV) (2011-2016)
Enseignement(s)
Les enseignements dispensés concernent principalement la biochimie et la biologie structurale des peptides et protéines, avec un accent mis d'une part sur les méthodes d'analyse structurale et en particulier la Résonance Magnétique Nucléaire (RMN), et d'autre part sur les activités et les mécanismes d'action, en prenant pour exemple les peptides antimicrobiens de microorganismes et d'organismes supérieurs. Ces enseignements se placent dans le cadre des enseignements de Master 2 du Muséum, spécialité MVE (Mécanismes du Vivant et Environnement).
Des cours dispensés à l'étranger élargissent ces domaines à d'autres méthodes d'analyse (spectrométrie de masse, séquençage de protéines par voie chimique,…) et à la description des mécanismes de biosynthèse des peptides antimicrobiens et de leurs modifications post-traductionnelles.
Activités de recherche
Les recherches sont centrées sur les aspects moléculaires des processus adaptatifs et des mécanismes de défense des microorganisms, en particulier bactéries et archées, dans différents écosystèmes. Les travaux concernent principalement les peptides antimicrobiens des bactéries (microcines et bactériocines) et des archées halophiles (halocines). Ces peptides sont isolés, purifiés et caractérisés sur le plan biochimique et structural pour décrypter les mécanismes moléculaires impliqués dans la reconnaissance de ces peptides par des récepteurs membranaires spécifiques et leurs interactions avec des cibles intracellulaires chez les bactéries sensibles. Les mécanismes de leur biosynthèse, assurée par des enzymes impliquées dans la maturation de leurs précurseurs protéiques et la mise en place dans certains cas de modifications post-traductionnelles pour conduire aux peptides matures actifs, sont étudiés. Le rôle écologique de ces peptides antimicrobiens est abordé, en particulier leur implication dans les compétitions microbiennes au sein de différents microbiotes, comme le microbiote intestinal.
Proceedings
Identification of Lasso and Branched-Cyclic Topoisomers Using Trapped Ion Mobility Spectrometry – Mass Spectrometry and Ion Spectroscopy
K Jeanne Dit Fouque1; J D. Hegemann2; S Zirah3; S Rebuffat3; P Maitre4; F Fernandez-Lima1
Proceedings 65th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics 2018 (San Diego CA, USA, 3-7 juin 2018)
Brevets
Dérivés de la purine pour leur utilisation dans le traitement ou la prévention de maladies dues à une mutation non-sens
S. Amand, F. Lejeune, C. Maulay-Bailly, S. Rebuffat
FR1660244, dépôt le 21.10.2016.
PCT/EP2017/076846, dépôt le 20.10.2017.
Lepista flaccida destiné à être utilisé dans le traitement d’une maladie due à une mutation non-sens
S. Amand, F. Lejeune, C. Maulay-Bailly, S. Rebuffat
FR1660229, dépôt le 21.10.2016
PCT/EP2017/076848, dépôt le 20.10.2017.
Publications
2019
- , 2019 — Haloarcula sebkhae sp. nov., an extremely halophilic archaeon from Algerian hypersaline environment. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology,. Vol. 69, n° 3, p. 732-738.ISSN:1466-5026,
- , 2019 — The extremely halophilic archaeon Halobacterium salinarum ETD5 from the solar saltern of Sfax (Tunisia) produces multiple halocins. Research in Microbiology.ISSN:0923-2508
- , 2019 — Structural signatures of the class III lasso peptide BI-32169 and the branched-cyclic topoisomers using trapped ion mobility spectrometry–mass spectrometry and tandem mass spectrometry. Analytical and Bioanalytical Chemistry. Vol. 411, n° 24, p. 6287-6296.ISSN:1618-2650
- , 2019 — Evidence of Cis/Trans-Isomerization at Pro7/Pro16 in the Lasso Peptide Microcin J25. Journal of The American Society for Mass Spectrometry. Vol. 30, n° 6, p. 1038-1045.ISSN:1879-1123
- , 2019 — Chemical communication in springtails: a review of facts and perspectives. Biology and Fertility of Soils. Vol. 55, n° 5, p. 425-438.ISSN:1432-0789
- , 2019 — Multifaceted ABC transporters associated to microcin and bacteriocin export. Research in Microbiology.ISSN:0923-2508
- , 2019 — The manifold roles of microbial ribosomal peptide-based natural products in physiology and ecology. The Journal of Biological Chemistry.ISSN:1083-351X
2018
- , 2018 — Synthesis, antimicrobial activity and conformational analysis of the class IIa bacteriocin pediocin PA-1 and analogs thereof. Scientific Reports. Vol. 8, n° 1, p. 9029.ISSN:2045-2322
- , 2018 — Identification of Lasso Peptide Topologies Using Native Nanoelectrospray Ionization-Trapped Ion Mobility Spectrometry–Mass Spectrometry. Analytical Chemistry. Vol. 90, n° 8, p. 5139-5146.ISSN:0003-2700, 1520-6882
- , 2018 — An orthogonal system for heterologous expression of actinobacterial lasso peptides in Streptomyces hosts. Scientific Reports. Vol. 8, n° 1, p. 8232.ISSN:2045-2322