Séverine ZIRAH

Séverine ZIRAH
Maître de conférences
Chargé(e) d’enseignement
Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Méthodes spectroscopiques (RMN, spectrométrie de masse), Biochimie.
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches

Contact

Réseaux sociaux
Téléphone
01 40 79 31 40
Adresse(s)

63 rue Buffon
75005 Paris

Responsabilités dans l'unité

  • Coordinatrice (avec Benjamin Marie) des plateaux techniques de RMN et de spectrométrie de masse bio-organique du Muséum
  • Co-organisation des séminaires d'unité
  • Membre élu au conseil d'unité

Enseignement(s)

  • Membre du Conseil de l'Ecole Doctorale 227 « Sciences de la Nature et de l'Homme : évolution et écologie » (Muséum national d’Histoire naturelle, Université Pierre et Marie Curie)
  • Co-responsable de la thématique de Master 2 « Molécules et Cibles Thérapeutiques » (MCT) inscrit dans le Master «Biologie Moléculaire et Cellulaire », Parcours type « Biochimie et Biologie Moléculaire » de Sorbonne Université et le Master « Biodiversité, Ecologie et Evolution », Parcours « Environnement Santé » du Muséum
  • Co-responsable des UEs ES6 : Molécules de défense et de communication des microorganismes, ES21 : Caractérisation, rôle et valorisation des molécules microbiennes, ES30 : Métabolites secondaires microbiens : de l'esploration de génomes à la caractérisation structurale, ES36 : Molécules et cibles thérapeutiques, ES15 : Satge de recherche

 

  • Cours et TD de méthodes spectroscopiques (RMN, spectrométrie de masse) appliqués à la caractérisation de peptides. Modules de M2 MVE (MVE21 parcours ES (ES21 thématique MES et ES36 thématique MCT)

  • Cours de métabolomique. Modules de M1 (MU4BM131, Sorbonne Université)

  • Cours sur la diversité et le rôle molécules microbiennes (antibiotiques, protéines de transport, molécules du quorum sensing…). Modules de M1 ES : ESE6

  • Cours de statistiques : introduction à R, statistiques descriptives, statistiques multivariées. Modules de M1 (TC3ini, TC3), M2 (SEP36) et modules d’école doctorale R applications et R analyses multivariées

  • Cours, TD et atelier de spectrométrie de masse, atelier de RMN, Licence Professionnelle « Développement du médicament » , IUT de Créteil

Activités de recherche

Peptides issus de la voie de biosynthèse ribosomale avec modifications post-traductionnelles (RiPPs) d’origine bactérienne : méthodes spectroscopiques globales et ciblées pour la caractérisation de RiPPs et la compréhension de leur rôle physiologique
Glycosylation des protéines de couche S et rôle dans tolérance des bactéries aux métaux et radionucléides
Protéomique appliquée à l’archéozoologie.

Publications

2019
  • Azémard Clara, Zazzo Antoine, Marie Arul, Lepetz Sébastien, Debaine-Francfort Corinne, Idriss Abduressul & Zirah Séverine, Octobre 2019 — Animal fibre use in the Keriya valley (Xinjiang, China) during the Bronze and Iron Ages: A proteomic approach. Journal of Archaeological Science. Vol. 110, p. 104996.
    ISSN: 
    0305-4403
    https://dx.doi.org/10.1016/j.jas.2019.104996
  • Chandramohan Archjana, Duprat Elodie, Remusat Laurent, Zirah Severine, Lombard Carine & Kish Adrienne, Janvier 2019 — Novel Mechanism for Surface Layer Shedding and Regenerating in Bacteria Exposed to Metal-Contaminated Conditions. Frontiers in Microbiology. Vol. 9, p. 3210.
    ISSN: 
    1664-302X
    https://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2018.03210
  • Jeanne Dit Fouque Kevin, Bisram Vikash, Hegemann Julian D., Zirah Séverine, Rebuffat Sylvie & Fernandez-Lima Francisco, 2019 — Structural signatures of the class III lasso peptide BI-32169 and the branched-cyclic topoisomers using trapped ion mobility spectrometry–mass spectrometry and tandem mass spectrometry. Analytical and Bioanalytical Chemistry. Vol. 411, n° 24, p. 6287-6296.
    ISSN: 
    1618-2650
    https://dx.doi.org/10.1007/s00216-019-01613-8
  • Jeanne Dit Fouque Kevin, Hegemann Julian D., Zirah Séverine, Rebuffat Sylvie, Lescop Ewen & Fernandez-Lima Francisco, 2019 — Evidence of Cis/Trans-Isomerization at Pro7/Pro16 in the Lasso Peptide Microcin J25. Journal of The American Society for Mass Spectrometry. Vol. 30, n° 6, p. 1038-1045.
    ISSN: 
    1879-1123
    https://dx.doi.org/10.1007/s13361-019-02134-5
  • Cersoy Sophie, Zirah Séverine, Marie Arul & Zazzo Antoine, 2019 — Toward a versatile protocol for radiocarbon and proteomics analysis of ancient collagen. Journal of Archaeological Science. Vol. 101, p. 1-10.
    ISSN: 
    0305-4403
    https://dx.doi.org/10.1016/j.jas.2018.10.009
2018
  • Bédard François, Hammami Riadh, Zirah Séverine, Rebuffat Sylvie, Fliss Ismail & Biron Eric, 2018 — Synthesis, antimicrobial activity and conformational analysis of the class IIa bacteriocin pediocin PA-1 and analogs thereof. Scientific Reports. Vol. 8, n° 1, p. 9029.
    ISSN: 
    2045-2322
    https://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-27225-3
  • Cersoy S., Daheur G., Zazzo A., Zirah S. & Sablier M., 2018 — Pyrolysis comprehensive gas chromatography and mass spectrometry: A new tool to assess the purity of ancient collagen prior to radiocarbon dating. Analytica Chimica Acta. Vol. 1041, p. 131-145.
    ISSN: 
    00032670
    https://dx.doi.org/10.1016/j.aca.2018.07.048
  • Jeanne Dit Fouque Kevin Jeanne, Moreno Javier, Hegemann JulianD., Zirah Séverine, Rebuffat Sylvie & Fernandez-Lima Francisco, 2018 — Identification of Lasso Peptide Topologies Using Native Nanoelectrospray Ionization-Trapped Ion Mobility Spectrometry–Mass Spectrometry. Analytical Chemistry. Vol. 90, n° 8, p. 5139-5146.
    ISSN: 
    0003-2700, 1520-6882
    https://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.7b05230
  • Le Meillour Louise, Zazzo Antoine, Lesur Joséphine, Cersoy Sophie, Marie Arul, Lebon Matthieu, Pleurdeau David & Zirah Séverine, 2018 — Identification of degraded bone and tooth splinters from arid environments using palaeoproteomics. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology. Vol. 511, p. 472-482.
    ISSN: 
    00310182
    https://dx.doi.org/10.1016/j.palaeo.2018.09.013
  • Mevaere Jimmy, Goulard Christophe, Schneider Olha, Sekurova Olga N., Ma Haiyan, Zirah Séverine, Afonso Carlos, Rebuffat Sylvie, Zotchev Sergey B. & Li Yanyan, 2018 — An orthogonal system for heterologous expression of actinobacterial lasso peptides in Streptomyces hosts. Scientific Reports. Vol. 8, n° 1, p. 8232.
    ISSN: 
    2045-2322
    https://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-26620-0
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