Les tutelles
CNRS-MNHN
Séverine ZIRAH
Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Méthodes spectroscopiques (RMN, spectrométrie de masse), Biochimie.
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Contact
Réseaux sociaux
Courriel
Téléphone
01 40 79 31 40
Adresse(s)
63 rue Buffon
75005 Paris
Responsabilités dans l'unité
- Coordinatrice (avec Benjamin Marie) des plateaux techniques de RMN et de spectrométrie de masse bio-organique du Muséum
- Co-organisation des séminaires d'unité
- Membre élu au conseil d'unité
Enseignement(s)
- Membre du Conseil de l'Ecole Doctorale 227 « Sciences de la Nature et de l'Homme : évolution et écologie » (Muséum national d’Histoire naturelle, Université Pierre et Marie Curie)
- Co-responsable de la thématique de Master 2 « Molécules et Cibles Thérapeutiques » (MCT) inscrit dans le Master «Biologie Moléculaire et Cellulaire », Parcours type « Biochimie et Biologie Moléculaire » de Sorbonne Université et le Master « Biodiversité, Ecologie et Evolution », Parcours « Environnement Santé » du Muséum
- Co-responsable des UEs ES6 : Molécules de défense et de communication des microorganismes, ES21 : Caractérisation, rôle et valorisation des molécules microbiennes, ES30 : Métabolites secondaires microbiens : de l'esploration de génomes à la caractérisation structurale, ES36 : Molécules et cibles thérapeutiques, ES15 : Satge de recherche
-
Cours et TD de méthodes spectroscopiques (RMN, spectrométrie de masse) appliqués à la caractérisation de peptides. Modules de M2 MVE (MVE21 parcours ES (ES21 thématique MES et ES36 thématique MCT)
-
Cours de métabolomique. Modules de M1 (MU4BM131, Sorbonne Université)
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Cours sur la diversité et le rôle molécules microbiennes (antibiotiques, protéines de transport, molécules du quorum sensing…). Modules de M1 ES : ESE6
-
Cours de statistiques : introduction à R, statistiques descriptives, statistiques multivariées. Modules de M1 (TC3ini, TC3), M2 (SEP36) et modules d’école doctorale R applications et R analyses multivariées
-
Cours, TD et atelier de spectrométrie de masse, atelier de RMN, Licence Professionnelle « Développement du médicament » , IUT de Créteil
Activités de recherche
Peptides issus de la voie de biosynthèse ribosomale avec modifications post-traductionnelles (RiPPs) d’origine bactérienne : méthodes spectroscopiques globales et ciblées pour la caractérisation de RiPPs et la compréhension de leur rôle physiologique
Glycosylation des protéines de couche S et rôle dans tolérance des bactéries aux métaux et radionucléides
Protéomique appliquée à l’archéozoologie.
Publications
2021
- 2021 — Untangling the fibre ball: Proteomic characterization of South American camelid hair fibres by untargeted multivariate analysis and molecular networking. Journal of Proteomics. Vol. 231, p. 104040.,ISSN:1874-3919
2020
- 2020 — Palaeoproteomics gives new insight into early southern African pastoralism. Scientific Reports. Vol. 10, n° 1, p. 14427.,ISSN:2045-2322
- 2020 — Phenomic and genomic approaches to studying the inhibition of multiresistant Salmonella enterica by microcin J25. Environmental Microbiology. Vol. 22, n° 7, p. 2907-2920.,ISSN:1462-2920
- 2020 — Bacteriocins to Thwart Bacterial Resistance in Gram Negative Bacteria. Frontiers in Microbiology. Vol. 11.,ISSN:1664-302X
- 2020 — Microcin J25 Exhibits Inhibitory Activity Against Salmonella Newport in Continuous Fermentation Model Mimicking Swine Colonic Conditions. Frontiers in Microbiology. Vol. 11, p. 988.,ISSN:1664-302X
2019
- Octobre 2019 — Animal fibre use in the Keriya valley (Xinjiang, China) during the Bronze and Iron Ages: A proteomic approach. Journal of Archaeological Science. Vol. 110, p. 104996.,ISSN:0305-4403
- Janvier 2019 — Novel Mechanism for Surface Layer Shedding and Regenerating in Bacteria Exposed to Metal-Contaminated Conditions. Frontiers in Microbiology. Vol. 9, p. 3210.,ISSN:1664-302X
- 2019 — Structural signatures of the class III lasso peptide BI-32169 and the branched-cyclic topoisomers using trapped ion mobility spectrometry–mass spectrometry and tandem mass spectrometry. Analytical and Bioanalytical Chemistry. Vol. 411, n° 24, p. 6287-6296.,ISSN:1618-2650
- 2019 — Evidence of Cis/Trans-Isomerization at Pro7/Pro16 in the Lasso Peptide Microcin J25. Journal of The American Society for Mass Spectrometry. Vol. 30, n° 6, p. 1038-1045.,ISSN:1879-1123
- 2019 — Toward a versatile protocol for radiocarbon and proteomics analysis of ancient collagen. Journal of Archaeological Science. Vol. 101, p. 1-10.,ISSN:0305-4403