Affiliation entity
ChemBioM Chemistry and Biology of Microorganisms
Interdisplinary research theme
Spectroscopic methods (mass spectrometry, NMR), Biochemistry
Researches
Accreditation to supervise research

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E-mail
severine.zirah [at] mnhn.fr
Phone
01 40 79 31 40
Address(es)

43 rue Buffon

24 allée des crapauds
75005 Paris

Responsibilities inside unit

  • Coordinator of the technical platforms of NMR and bio-organic mass spectrometry of the Museum
  • Co-organization of the lab seminars

Teaching

  • Membre du Conseil de l’Ecole Doctorale 227 « Sciences de la Nature et de l’Homme : évolution et écologie » (Muséum national d’Histoire naturelle, Université Pierre et Marie Curie)
  • Co-responsable du parcours de Master 2 « Molécules et Cibles Thérapeutiques » (MCT) inscrit dans le Master «Biologie Moléculaire et Cellulaire », Parcours type « Biochimie et Biologie Moléculaire » de l’UPMC et le Master « Evolution, Patrimoine Naturel et Sociétés », Spécialité « Mécanismes du Vivant et Environnement » du Muséum
  • Co-responsable des UEs MVE6 : Molécules de défense et de communication des microorganismes, MVE21 : Caractérisation, rôle et valorisation des molécules microbiennes, MVE30 : Isolement et caractérisations structurale de biomolécules, MVE36 : Molécules et cibles thérapeutiques
  • Cours et TD de méthodes spectroscopiques (RMN, spectrométrie de masse) appliqués à la caractérisation de peptides. Modules de M2 MVE (MVE21 parcours MES et MVE36 parcours MCT)
  • Cours de métabolomique et protéomique. Modules de M1 (4V131, UPMC) et M2 (MVE41)
  • Cours sur la diversité et le rôle molécules microbiennes (antibiotiques, protéines de transport, molécules du quorum sensing…). Modules de M1 MVE : MVE5, MVE6
  • Cours de statistiques : introduction à R, statistiques descriptives, statistiques multivariées. Modules de M1 (TC3ini, TC3), M2 (SEP36) et modules d’école doctorale R applications et R analyses multivariées
  • Cours, TD et atelier de spectrométrie de masse, atelier de RMN, Licence Professionnelle « Développement du médicament » , IUT de Créteil

Presentation

Research activities

  • Ribosomally synthesized and post-translationally modified peptides (RiPPs) from bacteria: global and targeted spectroscopic methods to discover new molecules by genome mining and investigate their physiological role
  • Anitmicrobial peptides from bacteria
  • Proteomics applied to archeozoology

Publications

2026
  • Casanova Emmanuelle, Davoudi Hossein, Zazzo Antoine, Zirah Séverine, Jacob Jérémy, Hatté Christine, Boco-Simon Audrey, Thil François, Gauthier Caroline, Nokandeh Jebrael, Alizadeh Abbas, Biglari Fereidoun, Bernbeck Reinhard, Pollock Susan, Tsuneki Akira et al., 2026 — Caprine dairy exploitation on the Iranian Plateau from the seventh millennium BC. Nature Human Behaviour vol. 10, n° 5, p. 849-859
    ISSN
    2397-3374
    https://dx.doi.org/10.1038/s41562-025-02396-y
  • Djamaa Soheib, Marie Arul, Paris Alain, Zirah Séverine & Domart-Coulon Isabelle, 2026 — Coral larval proteomics at onset of metamorphosis highlights innate immunity maturation in parallel to neuro-sensing and skeletal development. Frontiers in Physiology vol. 17, , p. 1763453
    ISSN
    1664-042X
    https://dx.doi.org/10.3389/fphys.2026.1763453
  • Santos-Fernandez Miguel, Jeanne Dit Fouque Kevin, Karki Ukesh, Blond Alain, Idir Ryane, Asgharihosseinpour Negin, Zirah Séverine, Chapagain Prem, Mebel Alexander M., Hegemann Julian D. & Fernandez-Lima Francisco, 2026 — Structural Landscape of Syanodin I Lasso Peptide. Biochemistry vol. 65, n° 9, p. 1455-1464
    ISSN
    0006-2960, 1520-4995
    https://dx.doi.org/10.1021/acs.biochem.6c00020
2025
  • Azémard Clara, Lepetz Sebastien, Debaine-Francfort Corinne, Abduressul Idriss, Fiorillo Denis, Zirah Séverine & Zazzo Antoine, February 2025 — Dietary reconstruction of domestic mammals in the Keriya Valley (Xinjiang, China) during the Bronze and Iron Ages using stable isotope analysis of animal hair. Journal of Archaeological Science: Reports vol. 61, , p. 104920
    ISSN
    2352-409X
    https://dx.doi.org/10.1016/j.jasrep.2024.104920
  • Antoine R., Leprevost L., Jünger S., Zirah S., Lippens G., Li Y., Dubiley S. & Jacob-Dubuisson F., 2025 — Multinuclear non-haem iron-dependent oxidative enzymes: landscape of their substrates, partner proteins and biosynthetic gene clusters. Microbial Genomics vol. 11, n° 7,
    ISSN
    2057-5858
    https://dx.doi.org/10.1099/mgen.0.001462
  • Mamjoud Amal, Zirah Séverine, Biron Eric, Fliss Omar & Fliss Ismail, 2025 — In Vitro Insights into Bacteriocin-Mediated Modulation of Chicken Cecal Microbiota. International Journal of Molecular Sciences vol. 26, n° 2, p. 755
    ISSN
    1422-0067
    https://dx.doi.org/10.3390/ijms26020755
  • Santos-Fernandez Miguel, Jeanne Dit Fouque Kevin, Karki Ukesh, Blond Alain, Zirah Séverine, Chapagain Prem P., Hegemann Julian D. & Fernandez-Lima Francisco, 2025 — Lasso Peptide Syanodin I: Loop-Pulling Two-Step Thermal Unthreading Mechanism. Analytical Chemistry vol. 97, n° 45, p. 25111-25119
    ISSN
    0003-2700, 1520-6882
    https://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.5c04118
2024
  • Baquero Fernando, Beis Konstantinos, Craik David J., Li Yanyan, Link A. James, Rebuffat Sylvie, Salomón Raúl, Severinov Konstantin, Zirah Séverine & Hegemann Julian D., 2024 — The pearl jubilee of microcin J25: thirty years of research on an exceptional lasso peptide. Natural Product Reports vol. 121, , e2408304121
    ISSN
    1460-4752
    https://dx.doi.org/10.1039/D3NP00046J
  • Leprevost Laura, Jünger Sophie, Lippens Guy, Guillaume Céline, Sicoli Giuseppe, Oliveira Lydie, Falcone Enrico, de Santis Emiliano, Rivera-Millot Alex, Billon Gabriel, Stellato Francesco, Henry Céline, Antoine Rudy, Zirah Séverine, Dubiley Svetlana et al., 2024 — A widespread family of ribosomal peptide metallophores involved in bacterial adaptation to metal stress. Proceedings of the National Academy of Sciences vol. 121, n° 49, e2408304121
    https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2408304121
  • Telhig Soufiane, Pham Nguyen Phuong, Ben Said Laila, Rebuffat Sylvie, Ouellette Marc, Zirah Séverine & Fliss Ismaïl, 2024 — Exploring the genetic basis of natural resistance to microcins. Microbial Genomics vol. 10, n° 2, p. 001156
    ISSN
    2057-5858
    https://dx.doi.org/10.1099/mgen.0.001156
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