Les tutelles
CNRS-MNHN
Marie-lise BOURGUET-KONDRACKI
Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Chimie des substances naturelles / Ecologie chimique et microbienne
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Spécialité
Holobionte marin, Produits naturels, Métabolomique, LC-MS/MS, RMN 1D et 2D, Symbiose.
Contact
Responsabilités dans l'unité
- Co-responsable des relations internationales de l’Unité
- Responsable formation de l’Unité
Enseignement(s)
- Master 2 du Muséum National d'Histoire Naturelle «Evolution, Patrimoine Naturel et Sociétés, Spécialité "Mécanisme du Vivant et Environnement" Parcours "Molécules et cibles thérapeutiques"»
- Master 2 : Recherche Drug Design – CERMN- Université de Caen Normandie
- Formation continue du MNHN, Animaux venimeux et vénéneux, Module 2/S2 Ecosystèmes marins.
Activités de recherche
- Diversité moléculaire chez les holobiontes marins (Eponges marines, coraux et leurs bactéries associées)
- Médiateurs moléculaires impliqués dans la symbiose marine
- Rôle des communautés microbiennes hébergées par les holobiontes (défense, nutrition, accumulation de métaux lourds…)
Direction de thèses
- Andrea Castaldi (ED 227, MNHN), en co-tutelle avec G. Le Pennec (MC Laboratoire de Biotechnologie et Chimie Marines, LBCM) “Process of diatoms’ adhesion: toward the elucidation of the molecular mechanisms”, thèse en cours.
- Huibin Wang (ED 227, MNHN), en co-tutelle avec S. Duperron (Professeur MNHN, Equipe CCE): “Exploring the potential of new benthic cyanobacteria strains from tropical mangroves for the production of new bioactive compounds”, thèse en cours.
- Germana Esposito (ED 227, MNHN), en co-tutelle avec V. Costantino (Professeur/Université Federico II de Naples) : « Stereostructural studies and biological activities of secondary metabolites from marine sources », thèse soutenue le 18 mai 2017.
- Cléa Bauvais, (ED IViv, Paris VI), en co-tutelle avec S. Zirah (MCM/MCAM) : « Diversité chimique et bactéries associées à S. officinalis, une éponge marine accumulatrice de métaux », thèse soutenue le 4 mars 2015.
- Samuel Dupont (ED IViv, Paris VI), co-encadrement A. Carré-Moulka (MCM/MCAM): « Diversité biologique et moléculaire du compartiment bactérien de l’éponge carnivore Asbestopluma hypogea », thèse soutenue le 29 octobre 2013.
- Mélanie Roué, (ED IViv, Paris VI), co-encadrement I. Domart-Coulon (MCM/MCAM), « Contribution de la flore bactérienne associée au métabolisme secondaire de l’éponge calcaire méditerranéenne Clathrina clathus », thèse soutenue le 30 mai 2011.
- Elodie Quévrain, (ED IViv, Paris VI), co-encadrement I. Domart-Coulon (MCM/MCAM), « Etude chimique et microbiologique d’un écosystème bactérien : cas de l’éponge calcaire Leuconia johnstoni », thèse soutenue le 29 juin 2010.
- Pierre Sauleau, Doctorat du MNHN : « Étude chimique et biologique de deux éponges marines de Mer Rouge : Lamellodysidea herbacea et Hyrtios erectus », thèse soutenue le 13 décembre 2005.
- Laurent Calcul, Doctorat du MNHN, en co-tutelle avec Ali Almourabit (DR CNRS/ ICSN Gif/Yvette), « Étude chimique et biologique des éponges marines Podospongia aff. loveni, Siphonochalina sp. et Xestospongia sp. isolement – bioactivité – approche de synthèse d’alcaloïdes de type benzo[de] [1,6] naphthyridine isolés de Xestospongia sp. », thèse soutenue le 30 septembre 2005.
Activités collectives
Responsable de projets scientifiques :
- WP1, Programme Européen PCR7 « BlueGenics- From gene to bioactive product: Exploiting marine genomics for an innovative European blue biotechnology industry (2012-2016)
- Programme PICS Vietnam « PORIFALONG » n° 6455 (2014-2016)
- Programme MAEE Bio-Asie MarSpongAsia (2010-2012)
- Programmes d’Actions Transversales du MNHN (ATM 2010-2015)
- Contrat de collaboration avec la société CoValMar (2008-2011)
- WP1, Programme ANR « ECIMAR -Ecologie chimique marine » (2007-2011)
Organisation de colloques/congrès :
Co-organisatrice de conférences nationales et/ou internationales :
- 2017 : Conférence internationale sur les holobiontes, 19-21 avril, MNHN, Paris.
- 2014 : 1ères Journées scientifiques nationales du GDR MediatEC, 28-30 octobre, CNRS, Paris.
- 2013 : 2ème Réunion européenne Bluegenics « From gene to bioactive product», 8-9 juillet, MNHN, Paris.
- 2005 : 4th European Conference on Marine Natural Products, 12-16 septembre, MNHN, Paris.
Autres activités :
- Responsable, Agreement Erasmus avec l’Université Federico II, Naples, Italie (2014-2021)
- Co-responsable de l’axe Dialogues moléculaires Procaryotes-procaryotes et Procaryotes-Eucaryotes, GDR MediatEC « Médiation chimique dans l’environnement, Ecologie chimique » (2014-2017).
- Co-responsable du pôle Micro-organismes et Interactions Procaryotes-Eucaryotes, GDR BioChiMar (Inc) (2010-2014).
Publications
2022
- Octobre 2022 — Computational Metabolomics Tools Reveal Subarmigerides, Unprecedented Linear Peptides from the Marine Sponge Holobiont Callyspongia subarmigera. A detailed examination of a unique molecular family, restricted to the Callyspongia genus, in a molecular network obtained from... Marine Drugs. Vol. 20, n° 11, p. 673.,ISSN:1660-3397
- 2022 — Valorisation of the diterpene podocarpic acid – Antibiotic and antibiotic enhancing activities of polyamine conjugates. Bioorganic & Medicinal Chemistry. Vol. 64, p. 116762.,ISSN:0968-0896
- 2022 — Metabolomics with multi-block modelling of mass spectrometry and nuclear magnetic resonance in order to discriminate Haplosclerida marine sponges. Analytical and Bioanalytical Chemistry. Vol. 414, n° 19, p. 5929-5942.,ISSN:1618-2650
- 2022 — Total Synthesis of the Four Stereoisomers of Cyclo(l-Trp-l-Arg) Raises Uncertainty of the Structures of the Natural Products and Invalidates Their Promising Antimicrobial Activities. Molecules. Vol. 27, n° 18, p. 5913.,ISSN:1420-3049
- 2022 — Discovery and Preliminary Structure-Activity Investigation of 3-Substituted-1H-imidazol-5-yl-1H-indoles with In Vitro Activity towards Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus. Antibiotics. Vol. 11, n° 10, p. 1450.,ISSN:2079-6382
2021
- 2021 — Repurposing primaquine as a polyamine conjugate to become an antibiotic adjuvant. Bioorganic & Medicinal Chemistry. Vol. 38, p. 116110.,ISSN:1464-3391
- 2021 — Spermine Derivatives of Indole-3-carboxylic Acid, Indole-3-acetic Acid and Indole-3-acrylic Acid as Gram-Negative Antibiotic Adjuvants. ChemMedChem. Vol. 16, n° 3, p. 513-523.,ISSN:1860-7187
2020
- 2020 — Editorial: Peptide/Polyketide Molecules From Marine Macro and/or Microorganisms. Editorial: Peptide/Polyketide Molecules From Marine Macro and/or Microorganisms. Frontiers in Chemistry. Vol. 8.,ISSN:2296-2646
- 2020 — Functional diversity of microboring Ostreobium algae isolated from corals. Environmental Microbiology. Vol. 22, n° 11, p. 4825-4846.,ISSN:1462-2912, 1462-2920
- 2020 — New Benthic Cyanobacteria from Guadeloupe Mangroves as Producers of Antimicrobials. Benthic cyanobacteria strains from Guadeloupe have been investigated for the first time by combining phylogenetic, chemical and... Mar. Drugs. Vol. 18, n° 1, p. 14.,