Entité de rattachement
ChemBioM Chimie et Biologie des Microorganismes
Thème interdisciplinaire de recherche
Métabolomique, Toxicologie, Chimie analytique, Métabolisme des xénobiotiques et Bioactivation métabolique, Biologie des systèmes et Statistiques multivariées.
Spécialité
Métabolomique et modélisation des interactions fonctionnelles des microorganismes et de l'hôte chez les organismes procaryotes et eucaryotes.

Contact

Courriel
alain.paris [at] mnhn.fr
Téléphone
01 40 79 54 12
Adresse(s)

43 rue Buffon

24 allée des crapauds
75005 Paris

Enseignements

  • Mastère du Muséum National d’Histoire Naturelle : « Evolution, patrimoines naturels & sociétés »
  • Master I: cours : « Métabolomique : aspects pratiques »
  • Master II : Orientation « Molécules et cibles thérapeutiques », cours : « Métabolomique pour une approche clinique renouvelée »
  • Master II : Orientation « Microbiology, environnement, santé », cours : « Métabolomique pour caractériser les écosystèmes »

Présentation

Activités de recherche

Utilisation de la métabolomique pour produire le phénotypage des organismes seuls en vue de caractériser les disruptions d’origine toxicologique ou de ceux placés en interaction fonctionnelle avec d’autres organismes afin de modéliser au niveau statistique les cas de symbiose, ceci en considérant dans les deux approches d’un point de vue longitudinal pour décrire différents états transitoires.

Collaborations :
 

  • 2014- : Dr. Estelle Rathahao-Paris (INRA) et Dr. Sandra Alves (Paris 6, Sorbonne Universités): Utilisation de la FT-MS pour phénotyper par métabolomique les urines collectées sur animaux modèles ou sur agriculteurs ou ouvriers agricoles exposés professionnellement à différents pesticides. Thèse de Béninia Habchi (2014-2017).
  • 2016- : Dr. Céline Domange (AgroParisTech, Paris) : Effet des saponines sur le métabolisme ruminal chez la chèvre et évaluation métabolique durant la lactation et la gestation. Thèse de Rafael Otaviano do Rego (Rio de Janeiro, Brazil)
  • 2015- : Dr. Isabelle Domart-Coulon et Dr. Marie-Lise Bourguet sur le phénotypage métabolomique des éponges et des coraux.
  • 2014- : Dr. Benjamin Marie et Dr. Benoît Sotton sur le phénotypage métabolomique des poissons d’eau douce exposés aux cyanobactéries.

Expertise :

Toxicologie en alimentation animale à l’agence nationale de sécurité alimentaire, environnement, travail (ANSES)

Publications

2026
  • Djamaa Soheib, Marie Arul, Paris Alain, Zirah Séverine & Domart-Coulon Isabelle, 2026 — Coral larval proteomics at onset of metamorphosis highlights innate immunity maturation in parallel to neuro-sensing and skeletal development. Frontiers in Physiology vol. 17, , p. 1763453
    ISSN
    1664-042X
    https://dx.doi.org/10.3389/fphys.2026.1763453
2022
  • Bekhti Nihel, Castelli Florence, Paris Alain, Guillon Blanche, Junot Christophe, Moiron Clémence, Fenaille François & Adel-Patient Karine, 2022 — The Human Meconium Metabolome and Its Evolution during the First Days of Life. Metabolites vol. 12, , p. 414
    ISSN
    2218-1989
    https://dx.doi.org/10.3390/metabo12050414
2021
  • Paris Alain, Labrador Boris, Lejeune François-Xavier, Canlet Cécile, Molina Jérôme, Guinot Michel, Mégret Armand, Rieu Michel, Thalabard Jean-Christophe & Le Bouc Yves, 2021 — Metabolomic signatures in elite cyclists: differential characterization of a seeming normal endocrine status regarding three serum hormones. Metabolomics vol. 17, , p. 67
    ISSN
    1573-3890
    https://dx.doi.org/10.1007/s11306-021-01812-4
  • Rathahao-Paris Estelle, Alves Sandra & Paris Alain, 2021 — « High-Throughput Metabolomics Using Flow Injection Analysis and Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometry » in Metabolomics.. vol. 159, , p. 9-23
    ISBN
    978-1-07-160864-7
    https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-0864-72
2020
  • Alves Sandra, Paris Alain & Rathahao-Paris Estelle, 2020 — Mass spectrometry-based metabolomics for an in-depth questioning of human health. Advances in Clinical Chemistry vol. 99, , p. 147-191
    ISSN
    2162-9471
    https://dx.doi.org/10.1016/bs.acc.2020.02.009
  • Lefort Gaëlle, Servien Rémi, Quesnel Hélène, Billon Yvon, Canario Laurianne, Iannuccelli Nathalie, Canlet Cécile, Paris Alain, Vialaneix Nathalie & Liaubet Laurence, 2020 — The maturity in fetal pigs using a multi-fluid metabolomic approach. Scientific Reports vol. 10, , p. 19912
    ISSN
    2045-2322
    https://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-76709-8
2019
  • Lefort Gaëlle, Liaubet Laurence, Canlet Cécile, Tardivel Patrick, Père Marie-Christine, Quesnel Hélène, Paris Alain, Iannuccelli Nathalie, Vialaneix Nathalie & Servien Rémi, 2019 — ASICS : an R package for a whole analysis workflow of 1D 1H NMR spectra. Bioinformatics vol. 35, , p. 4356-4363
    ISSN
    1367-4803
    https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btz248
  • Sotton Benoît, Paris Alain, Le Manach Séverine, Blond Alain, Duval Charlotte, Qiao Qin, Catherine Arnaud, Combes Audrey, Pichon Valérie, Bernard Cécile & Marie Benjamin, 2019 — Specificity of the metabolic signatures of fish from cyanobacteria rich lakes. Chemosphere vol. 226, , p. 183-191
    ISSN
    1879-1298
    https://dx.doi.org/10.1016/j.chemosphere.2019.03.115
  • Stojiljkovic Natali, Leroux Fanny, Bubanj Saša, Popot Marie-Agnès, Paris Alain, Tabet Jean-Claude & Junot Christophe, 2019 — Tracking main environmental factors masking a minor steroidal doping effect using metabolomic analysis of horse urine by liquid chromatography–high-resolution mass spectrometry. European Journal of Mass Spectrometry vol. 25, , p. 339-353
    ISSN
    1469-0667
    https://dx.doi.org/10.1177/1469066719839034
  • Tourneroche Anne, Lami Raphaël, Hubas Cédric, Blanchet Elodie, Vallet Marine, Escoubeyrou Karine, Paris Alain & Prado Soizic, 2019 — Bacterial–Fungal Interactions in the Kelp Endomicrobiota Drive Autoinducer-2 Quorum Sensing. Frontiers in Microbiology vol. 10, ,
    ISSN
    1664-302X
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2019.01693
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