Les tutelles
CNRS-MNHN
Alain PARIS
Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Métabolomique, Toxicologie, Chimie analytique, Métabolisme des xénobiotiques et Bioactivation métabolique, Biologie des systèmes et Statistiques multivariées.
Spécialité
Métabolomique et modélisation des interactions fonctionnelles des microorganismes et de l'hôte chez les organismes procaryotes et eucaryotes.
Contact
Enseignement(s)
- Mastère du Muséum National d'Histoire Naturelle : « Evolution, patrimoines naturels & sociétés »
- Master I: cours : « Métabolomique : aspects pratiques »
- Master II : Orientation "Molécules et cibles thérapeutiques", cours : « Métabolomique pour une approche clinique renouvelée »
- Master II : Orientation "Microbiology, environnement, santé", cours : « Métabolomique pour caractériser les écosystèmes »
Activités de recherche
Utilisation de la métabolomique pour produire le phénotypage des organismes seuls en vue de caractériser les disruptions d'origine toxicologique ou de ceux placés en interaction fonctionnelle avec d'autres organismes afin de modéliser au niveau statistique les cas de symbiose, ceci en considérant dans les deux approches d'un point de vue longitudinal pour décrire différents états transitoires.
Collaborations :
- 2014- : Dr. Estelle Rathahao-Paris (INRA) et Dr. Sandra Alves (Paris 6, Sorbonne Universités): Utilisation de la FT-MS pour phénotyper par métabolomique les urines collectées sur animaux modèles ou sur agriculteurs ou ouvriers agricoles exposés professionnellement à différents pesticides. Thèse de Béninia Habchi (2014-2017).
- 2016- : Dr. Céline Domange (AgroParisTech, Paris) : Effet des saponines sur le métabolisme ruminal chez la chèvre et évaluation métabolique durant la lactation et la gestation. Thèse de Rafael Otaviano do Rego (Rio de Janeiro, Brazil)
- 2015- : Dr. Isabelle Domart-Coulon et Dr. Marie-Lise Bourguet sur le phénotypage métabolomique des éponges et des coraux.
- 2014- : Dr. Benjamin Marie et Dr. Benoît Sotton sur le phénotypage métabolomique des poissons d'eau douce exposés aux cyanobactéries.
Expertise :
Toxicologie en alimentation animale à l'agence nationale de sécurité alimentaire, environnement, travail (ANSES)
Publications
2022
- 2022 — The Human Meconium Metabolome and Its Evolution during the First Days of Life. Metabolites. Vol. 12, p. 414.,ISSN:2218-1989
2021
- 2021 — Metabolomic signatures in elite cyclists: differential characterization of a seeming normal endocrine status regarding three serum hormones. Metabolomics. Vol. 17, p. 67.,ISSN:1573-3890
- 2021 — « High-Throughput Metabolomics Using Flow Injection Analysis and Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometry » in Metabolomics. Vol. 159, p. 9-23.,ISBN:978-1-07-160864-7
2020
- 2020 — Mass spectrometry-based metabolomics for an in-depth questioning of human health. Advances in Clinical Chemistry. Vol. 99, p. 147-191.,ISSN:2162-9471
- 2020 — The maturity in fetal pigs using a multi-fluid metabolomic approach. Scientific Reports. Vol. 10, p. 19912.,ISSN:2045-2322
2019
- Juillet 2019 — Specificity of the metabolic signatures of fish from cyanobacteria rich lakes. With the increasing impact of the global warming, occurrences of cyanobacterial blooms in aquatic ecosystems are becoming a... Chemosphere. Vol. 226, p. 183-191.,ISSN:1879-1298
- 2019 — Bacterial–Fungal Interactions in the Kelp Endomicrobiota Drive Autoinducer-2 Quorum Sensing. Frontiers in Microbiology. Vol. 10.,ISSN:1664-302X
- 2019 — ASICS : an R package for a whole analysis workflow of 1D 1H NMR spectra. Bioinformatics. Vol. 35, p. 4356-4363.,ISSN:1367-4803
- 2019 — Tracking main environmental factors masking a minor steroidal doping effect using metabolomic analysis of horse urine by liquid chromatography–high-resolution mass spectrometry. European Journal of Mass Spectrometry. Vol. 25, p. 339-353.,ISSN:1469-0667
2018
- Novembre 2018 — Potential of dynamically harmonized Fourier transform ion cyclotron resonance cell for high-throughput metabolomics fingerprinting: control of data quality. Analytical and Bioanalytical Chemistry. Vol. 410, n° 2, p. 483-490.,ISSN:1618-2642, 1618-2650