Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Biologie des organismes marins, Microbiologie environnementale, Microscopie, Biologie cellulaire, Biogéochimie, Ecophysiologie
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Spécialité
Symbioses - Interactions hôte-microorganismes - Biominéralisation - Carbonates - Cellules - Coraux - Scléractiniaires - Eponges - Porifères - Microbiote - Symbiodinium - Bactéries - Nutrition

Contact

Réseaux sociaux
Courriel
isabelle.domart-coulon [at] mnhn.fr
Téléphone
01 40 79 48 08
Adresse(s)

43 rue Buffon

24 allée des crapauds

75005 Paris

Responsabilités hors unité

  • Membre du Core Group et du Management Committee du programme européen Action COST CA16203 'Stem cells of marine/aquatic invertebrates: from basic research to innovative applications' (MARISTEM) - Responsable du WorkPackage 1 'Developing protocols for raising marine/aquatic invertebrate stem cells under in vitro conditions'
  • Expertise pour la Commission Européenne (programmes H2020, Marie-Curie 2016, etc…)
  • Professeure invitée à Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, ENAC IIE, Laboratory for Biological Geochemistry (depuis 2013)
  • Membre élue du Conseil Scientifique du Département Adaptations du Vivant (Aviv), du MNHN (depuis 2017)
  • Expertise institutionnelle en réponse à des demandes CITES et des douanes sur les coraux relayées par le Service Expertise du MNHN
  • Co-responsable scientifique (2008-2010) d’une convention de recherche avec la Jeune Entreprise Innovante COVALMAR pour la valorisation d’antimicrobiens issus de bactéries d’éponges marines

Collections

Enseignements

Présentation

Activités de recherche

Je m’intéresse aux organismes marins benthiques (coraux et éponges) vivant en symbiose avec des microrganismes procaryotes (bactéries, cyanobactéries) et microeucaryotes (Symbiodinium, champignons filamenteux, Ostreobium). La diversité taxonomique des partenaires de ces associations est étudiée en combinant approches moléculaires et cultures de ces microorganismes, isolés ou en co-culture avec des cellules de l’hôte. L’expérimentation en aquarium et la mise au point de cultures primaires de tissu de ces animaux marins sont des outils complémentaires qui permettent d’étudier le fonctionnement des microécosystèmes hôte-microbiote, en interaction avec leur environnement. Les relations hôte-symbiontes peuvent être nutritives (par exemple avec transferts de photosynthétats d’origine microbienne aux cellules de l’animal hôte), de défense vis-à-vis de pathogènes, ou avoir un rôle sur la métamorphose larvaire et la morphogénèse de l’animal hôte et sa biominéralisation. Ces relations varient au cours du cycle de vie de l’hôte, illustrant le caractère dynamique de la symbiose (continuum mutualisme-commensalisme- parasitisme). Les microorganismes et leur activité métabolique sont visualisés in situ dans les tissus ou le squelette de leur hôte par hybridation in situ, microscopie de fluorescence ou électronique, et cartographie élémentaire et d’enrichissement isotopique après incubation avec des précurseurs (métabolites) marqués (13C, 15N). Ces recherches se font en collaboration étroite avec des collègues chimistes et biochimistes, géochimistes et écologues. Les outils de cultures cellulaires sont développés dans le cadre du réseau européen COST Action 16203 'MARISTEM' (htpp://maristem.eu/), avec une attention particulière pour les cellules souches de cnidaires. Par ailleurs, j'étudie l'adhésion cellulaire des coraux à divers supports, colonisés ou non par des biofilms microbiens, dans la perspective d'optimiser le recrutement larvaire et la croissance corallienne.

Activités de diffusion des connaissances

  • Interface avec les médias : entretiens avec des journalistes de presse écrite (Le Point, Le Monde Science & technologie) radio (RTL la Curiosité est un vilain défaut; France-Inter Le Club des Têtes au Carré; France-Bleue Auvergne) télévision (France O); presse jeunesse (L'Esprit Sorcier Le Mag', Journal de Mickey), presse spécialisée en vulgarisation scientifique (Biofutur, Science et Avenir, Ca m’intéresse) – sur les thèmes coraux et leurs symbioses microbiennes, récifs coralliens, et biotechnologies marines
  • Conférences grand-public (récifs coralliens, symbioses marines, animaux marins côtiers, zoom sur la biologie d’un organisme marin – Cnidaire ou Porifère- …) au Muséum national d'Histoire Naturelle ou dans un réseau d’Aquarium publics de France, et pour la formation continue d’amateurs de plongée sous-marine.
  • production de supports de médiation scientifique en collaboration avec les Services de Médiation des aquariums (Aquarium Tropical du Palais de la Porte Dorée Paris, Océanopolis Brest), animation d'ateliers lycéens.

Autres titres universitaires et participations à des sociétés scientifiques

  • Ingénieur agronome AgroParisTech (INA Paris-Grignon) : 1988
  • Post-doctorats à Johns Hopkins University (MD, USA) 2000-2001 & 2004 et au Centre Scientifique de Monaco (Monaco) 2002-2003
  • Habilitation à diriger les recherches (HDR) de l’Université Paris-Sud (Orsay) : 2011
  • Professeur Invitée de l’Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, ENAC, Laboratory of Biological Geochemistry (depuis 2013)
  • Qualification sur liste d’aptitude aux fonctions de Professeur des Universités & Professeur du MNHN, CNU section 68 Biologie des organismes (depuis 2013)
  • Membre de la International Symbiosis Society
  • Membre de la Société Française de Microbiologie
  • Membre du Réseau des Interactions Durables (REID)
  • Membre du Consortium Tara Pacific

Edition d’ouvrages

S. Auzoux-Bordenave, I. Domart-Coulon. 2013. Proceedings of the Marine Invertebrate Cell Culture 2012 Symposium. Cytotechnology 65 (5) 673-689 (DOI 10.1007/s10616-013-9610-2) - Special Issue featuring peer-reviewed research papers and the abstracts of the MICC2012 Symposium presentations (held August 30-Sep 1st, 2012, in Concarneau, France)

Brevets

  • [Natural paraben compounds] Dépôt le 10 avril 2007, brevet européen, N° 07 290 438.6 Déposants : MNHN, CNRS, Université Pierre et Marie Curie (Paris 6). Co-Inventeurs : I Domart-Coulon, M.-L. Bourguet-Kondracki, E. Quévrain
  • WO/1993/011224: Culture media for cells of marine invertebrates [Milieux de culture pour des cellules d'Invertébrés marins] Dépôt le 6 décembre 1991 brevet français n° FR 91/15146 étendu à l’Europe, USA, Japan, Norway, n° PCT/FR 92/01147 [Culture media for marine invertebrate cells, especially mollusks] 19 p. Déposant : Bertin&Cie. Inventeur: I Domart-Coulon

 

 

 

Publications

2023
  • Massé Anaïs, Detang Juliette, Duval Charlotte, Duperron Sébastien, Woo Anthony C. & Domart-Coulon Isabelle, 2023Bacterial Microbiota of Ostreobium, the Coral-Isolated Chlorophyte Ectosymbiont, at Contrasted Salinities. Microorganisms vol. 11, n° 5, p. 1318
    ISSN
    2076-2607
2022
  • Domart-Coulon Isabelle & Blanchoud Simon, 2022From Primary Cell and Tissue Cultures to Aquatic Invertebrate Cell Lines: An Updated Overview. , , p. 1-64 In MDPI Books “Advances in aquatic invertebrate stem cell research.” B Rinkevich, B. Hobmayer, L Ballarin eds
    ISSN
    978-3-0365-1635-6 978-3-0365-1636-3
2021
  • Amalia Rosner, Jean Armengaud, Loriano Ballarin, Stéphanie Barnay-Verdier, Francesca Cima, Varela Coelho Ana, Isabelle Domart-Coulon, Damjana Drobne, Anne-Marie Genevière, Anita Jemec Kokalj, Ewa Kotlarska, Mark Lyons Daniel, Tali Mass, Guy Paz, Ksenia Pazdro et al., 2021Stem cells of aquatic invertebrates as an advanced tool for assessing ecotoxicological impacts. Science of The Total Environment , , p. 144565
    ISSN
    00489697
  • Ouédraogo Dakis-Yaoba, Perceval Olivier, Ferrier-Pagès Christine, Domart-Coulon Isabelle, Hédouin Laetitia, Burga Karen, Guillaume Mireille M. M., Calvayrac Christophe, Castelin Magalie, Reyjol Yorick & Sordello Romain, 2021Estimating ecotoxicological effects of chemicals on tropical reef-building corals; a systematic review protocol. Environmental Evidence vol. 10, n° 1, p. 35
    ISSN
    2047-2382
  • Ouédraogo Dakis-Yaoba, Delaunay Mathilde, Sordello Romain, Hédouin Laetitia, Castelin Magalie, Perceval Olivier, Domart-Coulon Isabelle, Burga Karen, Ferrier-Pagès Christine, Multon Romane, Guillaume Mireille M. M., Léger Clément, Calvayrac Christophe, Joannot Pascale & Reyjol Yorick, 2021Evidence on the impacts of chemicals arising from human activity on tropical reef-building corals; a systematic map. Environmental Evidence vol. 10, , p. 22
    ISSN
    2047-2382
2020
  • Ouédraogo Dakis-Yaoba, Sordello Romain, Brugneaux Sophie, Burga Karen, Calvayrac Christophe, Castelin Magalie, Domart-Coulon Isabelle, Ferrier-Pagès Christine, Guillaume Mireille M. M., Hédouin Laetitia, Joannot Pascale, Perceval Olivier & Reyjol Yorick, 2020What evidence exists on the impacts of chemicals arising from human activity on tropical reef-building corals? A systematic map protocol. Environmental Evidence vol. 9, n° 1, p. 18
    ISSN
    2047-2382
  • Massé Anaïs, Tribollet Aline, Meziane Tarik, Bourguet‐Kondracki Marie-Lise, Yéprémian Claude, Sève Charlotte, Thiney Najet, Longeon Arlette, Couté Alain & Domart‐Coulon Isabelle, 2020Functional diversity of microboring Ostreobium algae isolated from corals. Environmental Microbiology vol. 22, n° 11, p. 4825-4846
    ISSN
    1462-2920
  • Tourneroche Anne, Lami Raphaël, Burgaud Gaëtan, Domart-Coulon Isabelle, Li Wei, Gachon Claire, Gèze Marc, Boeuf Dominique & Prado Soizic, 2020The Bacterial and Fungal Microbiota of Saccharina latissima (Laminariales, Phaeophyceae). Frontiers in Marine Science vol. 7, , p. 587566
    ISSN
    2296-7745
2018
  • Massé A., Domart-Coulon I., Golubic S., Duché D. & Tribollet A., 2018Early skeletal colonization of the coral holobiont by the microboring Ulvophyceae Ostreobium sp.. Scientific Reports vol. 8, n° 1, p. 2293
    ISSN
    2045-2322
  • Gibbin E., Gavish A., Domart-Coulon I., Kramarsky-Winter E., Shapiro O., Meibom A. & Vardi A., 2018Using NanoSIMS coupled with microfluidics to visualize the early stages of coral infection by Vibrio coralliilyticus. BMC Microbiology vol. 18, n° 1, p. 39
    ISSN
    1471-2180