Les tutelles
CNRS-MNHN
Isabelle DOMART-COULON
Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Biologie des organismes marins, Microbiologie environnementale, Microscopie, Biologie cellulaire, Biogéochimie, Ecophysiologie
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Spécialité
Symbioses - Interactions hôte-microorganismes - Biominéralisation - Carbonates - Cellules - Coraux - Scléractiniaires - Eponges - Porifères - Microbiote - Symbiodinium - Bactéries - Nutrition
Contact
Réseaux sociaux
Courriel
Téléphone
01 40 79 48 08
Adresse(s)
63 rue Buffon
75005 Paris
Responsabilités hors unité
- Membre du Core Group et du Management Committee du programme européen Action COST CA16203 'Stem cells of marine/aquatic invertebrates: from basic research to innovative applications' (MARISTEM) - Responsable du WorkPackage 1 'Developing protocols for raising marine/aquatic invertebrate stem cells under in vitro conditions'
- Expertise pour la Commission Européenne (programmes H2020, Marie-Curie 2016, etc…)
- Professeure invitée à Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, ENAC IIE, Laboratory for Biological Geochemistry (depuis 2013)
- Membre élue du Conseil Scientifique du Département Adaptations du Vivant (Aviv), du MNHN (depuis 2017)
- Expertise institutionnelle en réponse à des demandes CITES et des douanes sur les coraux relayées par le Service Expertise du MNHN
- Co-responsable scientifique (2008-2010) d’une convention de recherche avec la Jeune Entreprise Innovante COVALMAR pour la valorisation d’antimicrobiens issus de bactéries d’éponges marines
Collection(s)
Chargée de Conservation de la collection nationale de Porifères du MNHN (depuis 2005) 15 000 spécimens et autant de préparations microscopiques dérivées, gestion de la conservation, des prêts et de l’accueil des visites de scientifiques.
Enseignement(s)
Enseignement en Master, UE co-habilitées MNHN et UPMC - UE ‘Biominéralisation’ en M1 MNHN spécialité Mécanismes du Vivant et de l’Environnement (MVE) - et UE ‘Biodiversité et écologie fonctionelle des microorganismes’ en M2 MNHN-UPMC parcours Microorganismes Environnement Santé (MES).
Activités de recherche
Je m’intéresse aux organismes marins benthiques (coraux et éponges) vivant en symbiose avec des microrganismes procaryotes (bactéries, cyanobactéries) et microeucaryotes (Symbiodinium, champignons filamenteux, Ostreobium). La diversité taxonomique des partenaires de ces associations est étudiée en combinant approches moléculaires et cultures de ces microorganismes, isolés ou en co-culture avec des cellules de l’hôte. L’expérimentation en aquarium et la mise au point de cultures primaires de tissu de ces animaux marins sont des outils complémentaires qui permettent d’étudier le fonctionnement des microécosystèmes hôte-microbiote, en interaction avec leur environnement. Les relations hôte-symbiontes peuvent être nutritives (par exemple avec transferts de photosynthétats d’origine microbienne aux cellules de l’animal hôte), de défense vis-à-vis de pathogènes, ou avoir un rôle sur la métamorphose larvaire et la morphogénèse de l’animal hôte et sa biominéralisation. Ces relations varient au cours du cycle de vie de l’hôte, illustrant le caractère dynamique de la symbiose (continuum mutualisme-commensalisme- parasitisme). Les microorganismes et leur activité métabolique sont visualisés in situ dans les tissus ou le squelette de leur hôte par hybridation in situ, microscopie de fluorescence ou électronique, et cartographie élémentaire et d’enrichissement isotopique après incubation avec des précurseurs (métabolites) marqués (13C, 15N). Ces recherches se font en collaboration étroite avec des collègues chimistes et biochimistes, géochimistes et écologues. Les outils de cultures cellulaires sont développés dans le cadre du réseau européen COST Action 16203 'MARISTEM' (htpp://maristem.eu/), avec une attention particulière pour les cellules souches de cnidaires. Par ailleurs, j'étudie l'adhésion cellulaire des coraux à divers supports, colonisés ou non par des biofilms microbiens, dans la perspective d'optimiser le recrutement larvaire et la croissance corallienne.
Activités de diffusion des connaissances
- Interface avec les médias : entretiens avec des journalistes de presse écrite (Le Point, Le Monde Science & technologie) radio (RTL la Curiosité est un vilain défaut; France-Inter Le Club des Têtes au Carré; France-Bleue Auvergne) télévision (France O); presse jeunesse (L'Esprit Sorcier Le Mag', Journal de Mickey), presse spécialisée en vulgarisation scientifique (Biofutur, Science et Avenir, Ca m’intéresse) – sur les thèmes coraux et leurs symbioses microbiennes, récifs coralliens, et biotechnologies marines
- Conférences grand-public (récifs coralliens, symbioses marines, animaux marins côtiers, zoom sur la biologie d’un organisme marin – Cnidaire ou Porifère- …) au Muséum national d'Histoire Naturelle ou dans un réseau d’Aquarium publics de France, et pour la formation continue d’amateurs de plongée sous-marine.
- production de supports de médiation scientifique en collaboration avec les Services de Médiation des aquariums (Aquarium Tropical du Palais de la Porte Dorée Paris, Océanopolis Brest), animation d'ateliers lycéens.
Autres titres universitaires et participations à des sociétés scientifiques :
- Ingénieur agronome AgroParisTech (INA Paris-Grignon) : 1988
- Post-doctorats à Johns Hopkins University (MD, USA) 2000-2001 & 2004 et au Centre Scientifique de Monaco (Monaco) 2002-2003
- Habilitation à diriger les recherches (HDR) de l’Université Paris-Sud (Orsay) : 2011
- Professeur Invitée de l’Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, ENAC, Laboratory of Biological Geochemistry (depuis 2013)
- Qualification sur liste d’aptitude aux fonctions de Professeur des Universités & Professeur du MNHN, CNU section 68 Biologie des organismes (depuis 2013)
- Membre de la International Symbiosis Society
- Membre de la Société Française de Microbiologie
- Membre du Réseau des Interactions Durables (REID)
- Membre du Consortium Tara Pacific
Edition d’ouvrages :
S. Auzoux-Bordenave, I. Domart-Coulon. 2013. Proceedings of the Marine Invertebrate Cell Culture 2012 Symposium. Cytotechnology 65 (5) 673-689 (DOI 10.1007/s10616-013-9610-2) - Special Issue featuring peer-reviewed research papers and the abstracts of the MICC2012 Symposium presentations (held August 30-Sep 1st, 2012, in Concarneau, France)
Brevets :
- [Natural paraben compounds] Dépôt le 10 avril 2007, brevet européen, N° 07 290 438.6 Déposants : MNHN, CNRS, Université Pierre et Marie Curie (Paris 6). Co-Inventeurs : I Domart-Coulon, M.-L. Bourguet-Kondracki, E. Quévrain
- WO/1993/011224: Culture media for cells of marine invertebrates [Milieux de culture pour des cellules d'Invertébrés marins] Dépôt le 6 décembre 1991 brevet français n° FR 91/15146 étendu à l’Europe, USA, Japan, Norway, n° PCT/FR 92/01147 [Culture media for marine invertebrate cells, especially mollusks] 19 p. Déposant : Bertin&Cie. Inventeur: I Domart-Coulon
Publications
2022
- 2022 — From Primary Cell and Tissue Cultures to Aquatic Invertebrate Cell Lines: An Updated Overview. P. 1-64. In MDPI Books “Advances in aquatic invertebrate stem cell research.” B Rinkevich, B. Hobmayer, L Ballarin eds.,ISSN:978-3-0365-1635-6 978-3-0365-1636-3
2021
- 2021 — Stem cells of aquatic invertebrates as an advanced tool for assessing ecotoxicological impacts. Science of The Total Environment. P. 144565.,ISSN:00489697
- 2021 — Estimating ecotoxicological effects of chemicals on tropical reef-building corals; a systematic review protocol. Environmental Evidence. Vol. 10, n° 1, p. 35.,ISSN:2047-2382
- 2021 — Evidence on the impacts of chemicals arising from human activity on tropical reef-building corals; a systematic map. Environmental Evidence. Vol. 10, p. 22.,ISSN:2047-2382
2020
- Décembre 2020 — The Bacterial and Fungal Microbiota of Saccharina latissima (Laminariales, Phaeophyceae). The sugar kelp Saccharina latissima dominates many temperate coastal ecosystems, plays key ecological roles and presents... Frontiers in Marine Science. Vol. 7, p. 587566.,ISSN:2296-7745
- 2020 — What evidence exists on the impacts of chemicals arising from human activity on tropical reef-building corals? A systematic map protocol. Environmental Evidence. Vol. 9, n° 1, p. 18.,ISSN:2047-2382
- 2020 — Functional diversity of microboring Ostreobium algae isolated from corals. Environmental Microbiology. Vol. 22, n° 11, p. 4825-4846.,ISSN:1462-2912, 1462-2920
- 2020 — Functional diversity of microboring Ostreobium algae isolated from corals. The filamentous chlorophyte Ostreobium sp. dominates shallow marine carbonate microboring communities, and is one of the major... Environmental Microbiology. Vol. 22, n° 11, p. 4825-4846. _eprint: https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/1462-2920.15256.,ISSN:1462-2920
2018
- 2018 — Early skeletal colonization of the coral holobiont by the microboring Ulvophyceae Ostreobium sp.. Scientific Reports. Vol. 8, n° 1, p. 2293.,ISSN:2045-2322
- 2018 — Using NanoSIMS coupled with microfluidics to visualize the early stages of coral infection by Vibrio coralliilyticus. BMC Microbiology. Vol. 18, n° 1, p. 39.,ISSN:1471-2180