Adrienne KISH
Maître de conférences
Chargé(e) d'enseignement
Entité de rattachement
ChemBioM Chimie et Biologie des Microorganismes
Thème interdisciplinaire de recherche
Microbiologie des environnements extrêmes, Mécanismes moléculaires de la survie des microorganismes
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Spécialité
Microbiologie (archées et bactéries), Extrêmophiles, Adaptations moléculaires et cellulaires aux environnements extrêmes, Exobiologie
Contact
Réseaux sociaux
Courriel
adrienne.kish [at] mnhn.fr
Téléphone
01 40 79 31 53
Adresse(s)
43 rue Buffon
24 allée des crapauds
75005 Paris
Responsabilités dans l'unité
Responsable du service de bactériologie
Membre nommé du conseil d’Unité MCAM
Responsabilités hors unité
Responsable de l’UE ES2 (« Introduction à la diversité des micro-organismes ») du Master BEES du Muséum National d’Histoire Naturelle (Parcours « Environnement, Santé »)
Responsable des communications en ligne Master MES (LinkedIn)
Membre élu du conseil exécutif « European Astrobiology Network Association » http://www.eana-net.eu/
Membre élu du conseil d’administration de la Société Française d’Exobiologie https://www.exobiologie.fr/
Membre experte : « European Space Agency Life Sciences Working Group (ESA LSWG) »
Membre experte : « European Space Agency Gateway / Moon Facility Definition Team »
Editeur invité, Frontiers in Microbiology, numéro spécial « Astrobiology At The Interface: Interactions Between Biospheres, Geospheres, Hydrospheres And Atmospheres Under Planetary Conditions »
Membre du comité de sélection, demandes de financements CNRS INSU programme TelluS action INTERRVIE (2018-2023)
Membre du comité de sélection, demandes de financement « Action Transversale du Muséum (ATM) »
Enseignements
Master 1 : Master « Biodiversité, Ecologie, Évolution » du Muséum National d’Histoire Naturelle, Parcours ES (Environnement, Santé)
TC1b : Tronc Commun - tutorat
ES2 : Introduction à la biodiversité des micro-organismes
ES5 : Diversité et biologie fonctionnelle des micro-organismes
ES6 : Molécules de défense et de communication des micro-organismes
Master 2 : Master « Evolution, patrimoine naturel et société » spécialité « Mécanismes du vivant et Environnement » MNHN et « Biologie Moléculaire et Cellulaire » spécialité « Microbiologie » Sorbonne Université
ES20 : Biodiversité et écologie fonctionnelle des microorganismes
ES21 : Caractérisation, rôle, et valorisation des molécules microbiennes
École Doctorale (ED227): « Interfaces microorganismes-minéraux dans l’histoire de la biogéosphère » et « Life at the Limits »
Présentation
Actualités
HDR - J’ai obtenu avec succès mon Habilitation à Diriger des Recherches (HDR) intitulée « Les surfaces des cellules procaryotes comme interfaces d’interaction dans des conditions extrêmes » présentant le travail effectué au cours de la dernière décennie dans mon laboratoire, en mettant l’accent sur le travail effectué par les excellents étudiant.e.s/jeunes chercheur.euse.s que j’ai eu le privilège d’encadrer. J’ai eu une discussion scientifique passionnante avec les membres de mon jury (Bénédicte Ménez, Roxane Lestini, Cédric Hubas, Mohamed Jebbar, Purificación Lopez-Garcia) autour des limites moléculaires de la vie, l’exobiologie et les surfaces cellulaires dans les environnements extrêmes.
Activités de recherche
Les environnements extrêmes présentent des challenges chimiques et physiques qui empêchent la survie des organismes biologiques. Les micro-organismes nommés « extrêmophiles » ont la capacité de s’adapter pour se protéger contre des dommages induis par leur milieu extrême. Nous utilisons une approche interdisciplinaire pour étudier les interactions entre les environnements extrêmes et les micro-organismes et identifier les mécanismes d’adaptations et de résistance qui permettent la survie de ces micro-organismes. Nos projets actuels sont ciblés sur la caractérisation des protéines de couche S (qui forment une structure ordonnée par auto-assemblage à la surface des cellules de type procaryote) dans les interactions micro-organisme/milieu abiotique, la préservation des biosignatures microbiennes dans le registre fossil (sur la Terre et la potentielle pour la vie microbienne sur d’autres planètes comme Mars).
Crédits
Adrienne Kish, Kjell Ove Storvik
Autres intérêts scientifiques
- L’origine et l’évolution de la vie
- Exobiologie
Sélection des publications antérieures à 2012
Glamoclija M, Fogel M, Steele A, Kish A. (2012) Microbial Nitrogen and Sulfur Cycles at the Gypsum Dunes of White Sands National Monument, New Mexico. Geomicrobiology Journal. 29:8, 733-51.
Kish A, Griffin P, Rogers K, Fogel M, Hemley R, Steele A. (2012) High-Pressure Tolerance in Halobacterium salinarum NRC-1 and Other Non-Piezophilic Prokaryotes. Extremophiles. 16(2):355-61.
Kish A, Kirkali G, Robinson C, Rosenblatt R, Jaruga P, Dizdaroglu M, and DiRuggiero J. (2009) Salt Shield: Intracellular Salts Provide Cellular Protection against Ionizing Radiation in the Halophilic Archaeon, Halobacterium salinarum str. NRC-1. Environ Microbiol. May;11(5):1066-78.
Whitehead K* & Kish A*, Pan M, Kaur A, Reiss DJ, King N, Hohmann L, DiRuggiero J, Baliga NS. (2006) An integrated systems approach for understanding cellular responses to gamma radiation. Mol.Syst.Biol. 2:47. (*co-premiers auteurs)
Kottemann M, Kish A, Iloanusi C, Bjork S, DiRuggiero J. (2005) Physiological Responses of the Halophilic Archaeon Halobacterium sp. str. NRC1 to Desiccation and Gamma Irradiation. Extremophiles Jun,9(3):219-27
Kish A, Hummerick M, Roberts M, Garland J, Maxwell S, Mills A. (2002) Biostability and microbiological analysis of Shuttle crew refuse. SAE Technical Paper 01–2356.
Activités collectives
- Participation à la fête de la science
- Membre des sociétés professionnelles suivantes: Société Française d’Exobiologie, Société Française de Biochimie et Biologie Moléculaire, European Astrobiology Network Association, American Society for Microbiology, American Association for the Advancement of Science, Mars Society of Canada, American Geophysical Union, European Association of Geochemistry
Projets
Projets actuels
Crédits
Adrienne Kish
Les projets « HALO » Ces projets portent sur les molécules utilisées par et transférées entre les micro-organismes qui aiment le sel (halophiles/halotolérants) dans les environnements hypersalins, avec un accent particulier sur l’enveloppe cellulaire et sa couche de surface protéique (« S-layer ») des haloarchées en tant qu’interface avec le milieu abiotique environnant. Financements : CNRS, MNHN
- Acclimatation des haloarchées à la survie dans les inclusions fluides de halite. Collaborateurs principaux : Charly Favreau (doctorant), Séverine Zirah, Marie Marugan, Benjamin Marie, Arul Marie, Rémy Puppo (MCAM, MNHN); Alicia Tribondeau (doctorante, PhyMA, MNHN); Arnaud Huguet (METIS, SU); Béatrice Alpha-Bazin (DRF/Li2D, CEA-Marcoule); François Guyot (IMPMC, MNHN/SU)
Pour en savoir plus : Comment les micro-organismes peuvent-ils vivre dans le sel ? Doctorant Charly Favreau et notre fantastique équipe de collaborateurs présentent de nouvelles méthodes clés pour isoler les protéines directement et spécifiquement de l’intérieur des inclusions fluide d’halite (goutte microscopique d’eau salée à l’intérieur de cristaux de sel NaCl), et révèlent pour la première fois les changements dans l’expression des protéines permettant à l’archée halophile Halobacterium salinarum de survivre au stade précoce après évaporation à l’intérieur des cristaux de sel : https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2022.1075274/full.
Crédits
Charly Favreau
- Effets de piégeage au sein des cristaux d’halite sur l’enveloppe cellulaire (structure, composition, fonctionnement) des archées halophiles vivants. Collaborateurs principaux : Elisa Ravaro (assistant ingénieur), Xavier Marques (MCAM, MNHN); David Burr (doctorant), Andreas Elsaesser (Freie Universität Berlin).
- Préservation des enveloppes cellulaires des archées halophiles en tant que biosignatures dans les cristaux de sel sous différents régimes de rayonnement solaire simulé. Collaborateurs principaux : Lucas Bourmancé (doctorant), Arul Marie, Rémy Puppo (MCAM, MNHN); Rubent Nitsche (doctorant), Andreas Elsaesser (Freie Universität Berlin); Sébastien Brûlé, Bertrand Raynal (Institut Pasteur); Philippe Schaeffer (Université de Strasbourg)
- Adaptation lipidique du micro-organisme Halobacterium salinarum dans des conditions de salinités extrêmes : implications pour la survie sur des temps longs. Collaborateurs principaux : Emelyne Joreau (doctorante), Arnaud Huguet (METIS, Sorbonne Université); Sarah Coffinet (Université de Rennes); Vincent Grossi (Institut Méditerranéen d’Océanologie)
Financements: CNRS
Crédits
Andreas Elsaesser
- ExocubeHALO (« Préservation des biosignatures de la surface cellulaire des micro-organismes HALOphiles exposés aux radiations spatiales sur Exocube »). Projet de collaboration Franco-Allemand en exobiologie entre Adrienne Kish et Andreas Elsaessar Andreas Elsaessar (PI Exocube https://www.elsaesserlab.space/projects/project-two-hd6hl). Collaborateurs principaux : Lucas Bourmancé (doctorant), Elisa Ravaro (assistant ingénieur), Bérénice Piquet, Séverine Zirah, Arul Marie, (MCAM, MNHN); Samuel Marre, Anaïs Cario, Maïder Abadie (ICMCB; https://www.icmcb-bordeaux.cnrs.fr/en/teams/group7/scientific/); David Burr (doctorant), Rubent Nitsche (doctorant), Andreas Elsaessar Andreas Elsaessar (Freie Universität Berlin).
Financements: ANR (ANR-PRCI ANR-21-CE49-0017-01), CNES programme Exobiologie
- ALPINE ( « Evaluation and Application of microbial membrane Lipids as (paleo)environmental Proxies In lacustriNe sEttings »). Collaboration avec porteur du projet Arnaud Huguet (Sorbonne Université)
Financements: ANR (ANR-22-CE01-0002)
Anciens projets
-Bio-(organo-)minéralisation et fossilisation de la couche S des microorganismes en conditions hydrothermales. Collaborateurs principaux: François Guyot, Sylvain Bernard, Jennyfer Miot, Laurent Remusat (IMPMC, MNHN)
Fe phosphate mineral-encrusted Sulfolobus acidocaldarius cell (hyperthermoacidophilic archaeon) observed by transmission electron microscopy. (Right) CryoTEM image of the amorphous Fe phosphate minerals (with accompanying EDX spectra) rendering the p3 hexagonal symmetry of the S. acidocaldarius S-layer visible (inset image). (Left) Cross-section of a Fe phosphate encrusted S. acidocaldarius cell showing the preserved S-layer structure (electron bright spots shown in inset image). Images from Kish, A., Miot, J., Lombard, C., Guigner, J-M., Bernard, S., Zirah, S., and Guyot, F. (2016)...
Crédits
© Adrienne Kish
Figure: Clichés MET des cellules de Sulfolobus acidocaldarius (archée hyperthermophile) encrustées avec des minéraux de phosphate de fer. Cliché cryoMET avec spectre EDX (image à droite), et cliché MET d’une coupe ultra-fine d’une cellule cellule minéralisée avec les protéines de couche S préservée (petits spots blancs à la surface des cellules, image à gauche).
Kish, A., Miot, J., Lombard, C., Guigner, J-M., Bernard, S., Zirah, S., and Guyot, F. (2016) Preservation of Archaeal Surface Layer Structure During Mineralization. Scientific Reports, 6:26152.
- Bioremédiation des métaux lourds et radionucléides - le rôle des exopolysaccharides (EPS) et des couches S des procaryotes (archées et bactéries) dans la biosorption et bioremédiation des métaux dans les environnements pollués par les métaux lourds à cause des activités anthropogéniques. Collaborateurs principaux: Virginie Chapon, Laurie Piette (CEA, DSV-IBEB-SBVME-LIPM); Séverine Zirah, Carine Lombard (MCAM, MNHN)
Chandramohan A, Remusat L, Duprat E, Zirah S, Lombard C, Kish A. 2019. Novel mechanism for surface layer shedding and regenerating in bacteria exposed to metal-contaminated conditions. Frontiers in Microbiology 9:3210.
Crédits
Adrienne Kish
Figure: Minéralisation de la couche S de la bactérie métallotolerante Lysinibacillus sp. TchIII 20n38 après exposition au Fe. (A) Clichés MEB des couches S minéralisées vides (sans cellule) B) Clichés MEB des cellules sortantes (flèches noires) des couches S minéralisées (flèches blanches) après incubation dans LB pendant 5 jours.
Chandramohan A, Remusat L, Duprat E, Zirah S, Lombard C, Kish A. (2019) Novel mechanism for surface layer shedding and regenerating in bacteria exposed to metal-contaminated conditions. Frontiers in Microbiology 9:3210.
Présentations récentes au grand public
2023 - conférencier invitée Les Nuits Etoilées d’Auvergne « Exobiologie : D’autres formes de vie dans l’univers ? »
2023 - conférencier invitée European Astrobiology Institute Academy « Life with a pinch of salt » https://www.youtube.com/watch?v=L7aeQr6Bfb4 (en anglais)
2022 – vidéo AstroBioEdu (Société Française d’Exobiologie) « Exobiologie en orbite » https://astrobioeducation.org/fr/video/43
2021 au présent – Membre du Comité d’Organisation des webinars « Archaea Power Hour Europa » pour (et par) des jeunes cheurcheur.euse.s
2021 - invitée du podcast « Joyful Microbe » https://joyfulmicrobe.com/extremophiles-adrienne-kish/ (en anglais)
2021 - « Skype a Scientist »
2021 - conférence grand public Cité des Sciences « Microbes de l’extrême: des durs à cuire » https://www.youtube.com/watch?v=w6UAXUV0FDk
2021 - invitée du podcast « Chercheuses » https://open.spotify.com/episode/3Tyiqbad6dE0F09gL1aDe8
2020 - webinaire grand public «La vie dans les milieux extrêmes», Les Jeudis de la Fondation Rovaltain Conférence, jeudi le 5 mars 2020 https://www.youtube.com/watch?v=e9CldAShlwA
2019 - invitée de l’émission de « La Méthode Scientifique » sur France Culture le 13 mai 2019, « Extrêmophiles : la vie à toute épreuve » Adrienne Kish et Patrick Forterre, https://www.franceculture.fr/emissions/la-methode-scientifique/la-methode-scientifique-emission-du-lundi-13-mai-2019
2018 - conférence grand public « Bizarre, comme c’est bizarre! (Les extrêmophiles: Les formes de vie insolites sur Terre) », Société des Amis du Muséum, MNHN, Paris, France <https://www.facebook.com/events/603520906709208/>
2017 - invitée « Mardis de l’espace » du CNES « Planètes habitables, planètes habitées? » Paris, FRANCE (Kish A, Butel B, Turbet M, Viso, M.) https://www.youtube.com/watch?v=HnqKHdFyTrQ
Publications
2023
- , 2023 — Future space experiment platforms for astrobiology and astrochemistry research. npj Microgravity vol. 9, n° 1, p. 1-9ISSN2373-8065
- , 2023 — Molecular acclimation of Halobacterium salinarum to halite brine inclusions. Frontiers in Microbiology vol. 13, , p. 1075274ISSN1664-302X
- , 2023 — Membrane lipid adaptation of soil Bacteroidetes isolates to temperature and pH. Frontiers in Microbiology vol. 14, , p. 1032032ISSN1664-302X
2020
- , 2020 — Improved Isolation of SlaA and SlaB S-layer proteins in Sulfolobus acidocaldarius. Extremophiles vol. 24, n° 4, p. 673-680ISSN1433-4909
2019
- , 2019 — Novel Mechanism for Surface Layer Shedding and Regenerating in Bacteria Exposed to Metal-Contaminated Conditions. Frontiers in Microbiology vol. 9, , p. 3210ISSN1664-302X
2017
- , 2017 — Experimental maturation of Archaea encrusted by Fe-phosphates. Scientific Reports vol. 7, n° 1, p. 16984ISSN2045-2322
2016
- , 2016 — Post-translational methylations of the archaeal Mre11:Rad50 complex throughout the DNA damage response. Molecular microbiology vol. 100, n° 2, p. 362-78ISSN1365-2958 (Electronic) 0950-382X (Linking)
- , 2016 — Preservation of Archaeal Surface Layer Structure During Mineralization. Scientific Reports vol. 6, n° 1, p. 26152ISSN2045-2322
2015
- , 2015 — « Electrophoresis » in Encyclopedia of Astrobiology.. Encyclopedia of Astrobiology , , dir. Springer-Verlag GmbH p. 718-719 DOI: 10.1007/978-3-642-11274-4