Entité de rattachement
CYANO Cyanobactéries et Environnement
Thème interdisciplinaire de recherche
Écotoxicologie des Cyanobactéries
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Spécialité
Écotoxicologie des Cyanobactéries

Contact

Réseaux sociaux
Courriel
cecile.bernard [at] mnhn.fr
Téléphone
01 40 79 31 83
Adresse(s)

12 rue Buffon
75005 Paris

Responsabilités hors unité

Implication dans le management de la recherche au niveau local :

2020 - …          Directrice de la Recherche du Muséum National d’Histoire Naturelle

Direction Générale Déléguée à la Recherche, l’Expertise, la Valorisation et l’Enseignement-formation (DGD REVE), 57 rue Cuvier - CP 17 - 75231 Paris Cedex 05

La mission de Directrice de la Recherche pour l’établissement consiste à :

  • Contribuer à la définition de la politique de recherche de l’établissement, dans le cadre des objectifs du contrat quinquennal et de la politique partenariale animée par la DGD-REVE, la Présidence et en s’appuyant sur les avis des instances statutaires de l’Établissement.
  • Mettre en œuvre la politique de recherche de l’établissement en menant les actions suivantes : i) accentuer le développement des interfaces de la recherche avec les autres domaines d’activité de la mission statutaire du Muséum ; ii) stimuler et de soutenir les transversalités entre départements; ii) accroître les moyens de la recherche.
  • Accompagner et coordonner les activités de la plateforme analytique du Muséum (PAM) et des unités d’appui à la recherche,
  • Préparer, suivre le budget de la direction de la recherche au sein de la DGD REVE
  • Assurer la mise en place et le suivi des indicateurs de la recherche
  • Représenter en tant que de besoin la politique de recherche de l’établissement

Implication dans le management de la recherche au niveau national :

  • Membre nommée de la section 20 du comité national de la recherche scientifique (2004-2012)
  • Membre nommée au bureau de la section 20 (2007-2012)
  • Membre du GT9 Allenvi « Risques environnementaux, naturels et écotoxiques » pour le CNRS & le MNHN (2010-2016)
  • Membre du Conseil Scientifique de l’ED EPHE (2011-2019)
  • Représentante MNHN au Sénat académique du PRES Sorbonne Universités (2011-2014)
  • Membre du Comité Scientifique de l’action thématique microbien du programme national EC2CO de l’Institut National des Sciences de l’Univers, division SIC (Surfaces et Interfaces Continentales) du CNRS (2007-2011 et 2015- 2020)
  • Membre du bureau du RTP Ecotoxicomic (2015-2019)

 

Pilotage et/ou participation dans les programmes de recherche :

  • Programmes nationaux : EC2CO, ANSES (2), R2DS, DGS, Programme National Arcachon (resp. task), ANR CYANOTOX_SEST (porteur), ANR PULSE_CEP&S (resp. task), ANR DZIANI (resp. task), ANR CYPHER (porteur) ; ANR SUBSILAKE (coord. pour le MNHN
  • Partenariat industriel ou régional : Conseil Département de Seine Saint Denis, Veolia environnement, SEDIF, Algama, Thermes de Balaruc les Bains.

Collections

Enseignements

Présentation

Travaux de recherche

Mon activité de recherche au travers l’encadrement d’étudiants en thèse et d’animation de la recherche dans plusieurs programmes nationaux et internationaux s’articulent autour de plusieurs items :

  • DIVERSITÉ DU PHYTOPLANCTON, DES CYANOBACTÉRIES ET DES CYANOTOXINES

En alliant plusieurs approches : les caractères morphologiques observables par microscopie photonique ou électronique, les caractères moléculaires qui renseigne sur la phylogénie des taxa étudiés et la diversité des fonctions (e.g. métabolites et molécules). La description et la conservation de cette diversité est une activité forte au sein de l’UMR7245 et du MNHN.
Les bases de données obtenues sont un support aux questions scientifiques concernant la diversité taxonomique et fonctionnelle du phytoplancton et cela, à plusieurs échelles : locale (plan d’eau), régionale (Ile de France) et globale (sur plusieurs régions du monde).

  • FACTEURS DE CONTRÔLE DE LA DYNAMIQUE DES CYANOBACTÉRIES ET DE LA PRODUCTION DE TOXINES

A l’échelle régionale (e.g. Ile de France) ou locale (e.g. Lac Dziani, Mayotte) , les contextes environnementaux au développement des cyanobactéries et des cyanotoxines sont étudiés et analysés par des approches de modélisation statistique mettant en jeu des variables alliant les caractéristiques morphologiques des plans d’eau et la nature de leurs bassins versants, des caractéristiques géochimiques, météorologiques et biologiques (e.g.. diversité des communautés microbiennes et leurs interactions).

  • EFFETS TOXICOLOGIQUES DES CYANOBACTÉRIES

Ceux-ci sont étudiés sur plusieurs modèles (des tests enzymatiques, lignées cellulaires au médaka). La complémentarité de ces modèles permet d’identifier une toxicité liée à la présence de cyanotoxines clairement identifiées mais également de caractériser leur mode d’action via la caractérisation des cibles par l’utilisation de molécules synergiques ou compétitrices.

  • UNE EXPERTISE SCIENTIFIQUE AU SERVICE D’UNE DEMANDE SOCIÉTALE

Des systèmes de surveillances et d’alerte en temps réel ont été développés pour la gestion des risques liés aux proliférations de cyanobactéries et aux risques liés à la production de toxines. Selon des arbres décisionnels bien définis, une aide à la décision quant aux usages des plans d’eau contaminés est apporté aux gestionnaires des plans d’eau (potable, activités récréatives ou de productions piscicole).

Publications

2025
  • Foucault Pierre, Halary Sébastien, Duval Charlotte, Goto Midoli, Marie Benjamin, Hamlaoui Sahima, Jardillier Ludwig, Lamy Dominique, Lance Emilie, Raimbault Emmanuelle, Allouti Fayçal, Troussellier Marc, Bernard Cécile, Leloup Julie & Duperron Sébastien, février 2025A summer in the greater Paris: trophic status of peri-urban lakes shapes prokaryotic community structure and functional potential. With more than 12 million inhabitants, the Greater Paris offers a “natural laboratory” to explore the effects of eutrophication… Environmental Microbiome vol. 20, n° 1, p. 24
    ISSN
    2524-6372
  • Roussel Théotime, Hubas Cédric, Halary Sébastien, Chynel Mathias, Duval Charlotte, Cadoret Jean-Paul, Meziane Tarik, Vernès Léa, Yéprémian Claude, Bernard Cécile & Marie Benjamin, janvier 2025Limnospira (Cyanobacteria) chemical fingerprint reveals local molecular adaptation. Microbiology Spectrum , , e01901–24 Publisher: American Society for Microbiology
2024
  • Vigneron Adrien, Cloarec Lilian A., Agogué Hélène, Bernard Cécile, Duperron Sébastien, Leboulanger Christophe, Carré Claire, Got Patrice, Roques Cécile, Troussellier Marc, Jézéquel Didier, Groleau Alexis, Ader Magali, Oger Philipe M. & Hugoni Mylène, septembre 2024Seismic events as potential drivers of the microbial community structure and evolution in a paleo-ocean analog. Anthropogenic perturbations profoundly affect aquatic ecosystem microbiomes and associated ecological functions. Comparatively,… Communications Earth & Environment vol. 5, n° 1, p. 1-9 Publisher: Nature Publishing Group
    ISSN
    2662-4435
  • Duperron Sébastien, Halary Sébastien, Bouly Jean-Pierre, Roussel Théotime, Hugoni Myléne, Bruto Maxime, Oger Philippe M., Duval Charlotte, Woo Anthony, Jézéquel Didier, Ader Magali, Leboulanger Christophe, Agogué Hélène, Grossi Vincent, Troussellier Marc et al., avril 2024Transcriptomic insights into the dominance of two phototrophs throughout the water column of a tropical hypersaline-alkaline crater lake (Dziani Dzaha, Mayotte).

    Saline-alkaline lakes often shelter high biomasses despite challenging conditions, owing to the occurrence of highly adapted… Frontiers in Microbiology vol. 15, , Publisher: Frontiers

    ISSN
    1664-302X
  • Halary Sébastien, Duval Charlotte, Marie Benjamin, Bernard Cécile, Piquet Bérénice, Gros Olivier, Bourguet-Kondracki Marie-Lise & Duperron Sébastien, janvier 2024Genomes of nine biofilm-forming filamentous strains of Cyanobacteria (genera Jaaginema, Scytonema, and Karukerafilum gen. nov.) isolated from mangrove habitats of Guadeloupe (Lesser Antilles). Biofilm-forming cyanobacteria are abundant in mangrove ecosystems, colonizing various niches including sediment surface and… FEMS Microbes vol. 5, , xtad024
    ISSN
    2633-6685
2023
  • Bruto Maxime, Oger Philippe M., Got Patrice, Bernard Cécile, Melayah Delphine, Cloarec Lilian A., Duval Charlotte, Escalas Arthur, Duperron Sébastien, Guigard Ludivine, Leboulanger Christophe, Ader Magali, Sarazin Gerard, Jézéquel Didier, Agogué Hélène et al., octobre 2023Phytoplanktonic species in the haloalkaline Lake Dziani Dzaha select their archaeal microbiome. Microorganisms are key contributors of aquatic biogeochemical cycles but their microscale ecology remains largely unexplored,… Molecular Ecology , ,
    ISSN
    1365-294X
  • Roussel Théotime, Halary Sébastien, Duval Charlotte, Piquet Bérénice, Cadoret Jean-Paul, Vernès Léa, Bernard Cécile & Marie Benjamin, août 2023Monospecific renaming within the cyanobacterial genus Limnospira (Spirulina) and consequences for food authorization. The cyanobacterial genus, Limnospira (anc. Arthrospira Stizenberger ex Gomont 1892), commonly called “Spirulina”, is widely… Journal of Applied Microbiology vol. 134, n° 8, lxad159
    ISSN
    1364-5072
  • Halary Sébastien, Duperron Sébastien, Kim Tiam Sandra, Duval Charlotte, Bernard Cécile & Marie Benjamin, juin 2023Intra-population genomic diversity of the bloom-forming cyanobacterium, Aphanizomenon gracile, at low spatial scale. Cyanobacteria are oxygenic photosynthetic bacteria that perform a substantial part of the global primary production. Some… ISME Communications vol. 3, n° 1, p. 1-4 Number: 1 Publisher: Nature Publishing Group
    ISSN
    2730-6151
  • Wang Huibin, Halary Sébastien, Duval Charlotte, Bernard Cécile, Troussellier Marc, Beniddir Mehdi A., Brunel Jean-Michel, Castaldi Andrea, Caudal Flore, Golléty Claire, Martin Coralie, Bourguet-Kondracki Marie-Lise & Duperron Sébastien, 2023Diversity, metabolome profiling and bioactivities of benthic filamentous cyanobacteria isolated from coastal mangroves of Mayotte. Frontiers in Marine Science vol. 10, ,
    ISSN
    2296-7745
2022
  • Gaëtan Juliette, Halary Sébastien, Millet Maxime, Bernard Cécile, Duval Charlotte, Hamlaoui Sahima, Hecquet Amandine, Gugger Muriel, Marie Benjamin, Mehta Neha, Moreira David, Skouri-Panet Fériel, Travert Cynthia, Duprat Elodie, Leloup Julie et al., décembre 2022Widespread formation of intracellular calcium carbonates by the bloom-forming cyanobacterium Microcystis. The formation of intracellular amorphous calcium carbonates (iACC) has been recently observed in a few cultured strains of… Environmental Microbiology , ,
    ISSN
    1462-2920