Les tutelles
CNRS-MNHN
Castaldi Andrea
Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Processus d'adhésion des diatomées : vers l’élucidation de mécanismes moléculaires
Spécialité
Adhésion, Diatomée, Transcriptomique, Métabolomique, Statistiques multivariées, Antifouling
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Téléphone
01 40 79 31 44
Adresse(s)
63 rue Buffon
75005 Paris
Activités de recherche
Les diatomées sont, avec les bactéries, les premiers organismes à coloniser les structures immergées engendrant des problèmes de salissure (ou fouling). Les derniers travaux sur le design de nouveaux antifoulings non-toxiques se basent sur des stratégies qui modifient les revêtements. Notre approche, en rupture avec ces précédentes études, propose de déterminer si les diatomées disposeraient de mécanisme d’adhésion s’adaptant au substrat rencontré.
Notre projet s’attachera à mettre en évidence de potentielles variabilités du métabolome des diatomées Phaeodactylum tricornutum, Cylindrotheca closterium et Amphora coffaeformis, en fonction de leur capacité d’adhésion sur trois substrats différents (verre, polystyrène, polydimethylsiloxane). Deux approches complémentaires seront développées qui utilisent les méthodes modernes et innovantes que sont la génétique avec des analyses transcriptomiques et la métabolomique (spectrométrie de masse, résonnance magnétique nucléaire et modélisations de statistiques multivariée) avec l’étude des réseaux moléculaires, afin d'identifier respectivement les gènes et les molécules produites sur des revêtements spécifiques.
Ces travaux permettront de décrire et comprendre les mécanismes moléculaires de l’adhésion des diatomées, de définir les caractères des surfaces antifouling, de connaître les métabolites impliqués dans les phénomènes adhésifs. Cette étude participera à l’innovation dans le design de matériaux antifoulings en tenant compte de la réalité du processus d’adhésion des diatomées.
Publications
2022
- Octobre 2022 — Computational Metabolomics Tools Reveal Subarmigerides, Unprecedented Linear Peptides from the Marine Sponge Holobiont Callyspongia subarmigera. A detailed examination of a unique molecular family, restricted to the Callyspongia genus, in a molecular network obtained from... Marine Drugs. Vol. 20, n° 11, p. 673.,ISSN:1660-3397