Sylvie REBUFFAT
Professeur(e)
Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Biochimie des protéines; Biochimie structurale; Analyse structurale (Spectrométrie de masse, RMN); Microbiologie
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches
Spécialité
Peptides antimicrobiens; Bactériocines, Microcines, Halocines; Modifications post-traductionnelles; Mécanismes d'action; Mécanismes de biosynthèse; Microbiote
Contact
Courriel
sylvie.rebuffat [at] mnhn.fr
Téléphone
01 40 79 31 18
Adresse(s)
63 rue Buffon
75005 Paris
Responsabilités dans l'unité
Responsabilités antérieures
- Directeur du Laboratoire Molécules de Communication et Adaptation des Microorganismes (MCAM), UMR 7245 CNRS-MNHN (2007-2016)
- Directeur de l'équipe Molécules de défense et de communication dans les écosystèmes microbiens (MDCEM) (2007-2013)
Responsabilités hors unité
Activités actuelles
- Membre du Comité Scientifique de l’Ifremer (2014-2019; renouvelé en 2020).
- Membre de comités de visite d’unités de recherche pour le HCERES (Haut Conseil de l'Evaluation de la Recherche et de l'Enseignement Supérieur) 2021
- Professeur associé à l’Université Laval, Québec, Canada (depuis octobre 2017)
- Membre du Comité éditorial de la revue scientifique Applied and Environmental Microbiology (depuis 2020 ; renouvellé en 2022).
- Membre du Comité éditorial de la revue scientifique Frontiers in Nutrition- Section Nutrition and and Microbes (depuis 2020).
- Membre du comité éditorial de la revue scientifique Frontiers in Microbiology- Section Antimicrobialq, resistance and chemotherapy (depuis 2022).
Responsabilités antérieures
- Directeur de la Recherche, de l'Expertise et de la Valorisation du MNHN (Direction de la Recherche, de l'Expertise et de la Valorisation, DiREV) (2011-2016)
Enseignements
Les enseignements dispensés concernent principalement la biochimie et la biologie structurale des peptides et protéines, avec un accent mis d'une part sur les méthodes d'analyse structurale et en particulier la Résonance Magnétique Nucléaire (RMN), et d'autre part sur les activités et les mécanismes d'action, en prenant pour exemple les peptides antimicrobiens de microorganismes et d'organismes supérieurs. Ces enseignements se placent dans le cadre des enseignements de Master 2 du Muséum, spécialité MVE (Mécanismes du Vivant et Environnement).
Des cours dispensés à l'étranger élargissent ces domaines à d'autres méthodes d'analyse (spectrométrie de masse, séquençage de protéines par voie chimique,…) et à la description des mécanismes de biosynthèse des peptides antimicrobiens et de leurs modifications post-traductionnelles.
Présentation
Activités de recherche
Les recherches sont centrées sur les aspects moléculaires des processus adaptatifs et des mécanismes de défense des bactéries. Les peptides antimicrobiens produits par les bactéries (que l’on nomme microcines et bactériocines) sont isolés, purifiés et caractérisés sur le plan biochimique et structural pour décrypter les mécanismes moléculaires impliqués dans la reconnaissance de ces peptides par des récepteurs membranaires spécifiques et leurs interactions avec des cibles intracellulaires chez les bactéries sensibles. Certaines microcines et bactériocines portent des modifications posttraductionnelles. Elles font alors partie de la famille des peptides ribosomaux modifiés posttraductionnellement (ribosomally synthesized and posttranslationally modified peptides, RiPPs), actuellement en pleine expansion. Les mécanismes de leur biosynthèse, assurée par des enzymes impliquées dans la maturation de leurs précurseurs protéiques et la mise en place des modifications post-traductionnelles pour conduire aux peptides matures actifs, sont étudiés. Le rôle écologique de ces peptides antimicrobiens est abordé, en particulier leur implication dans les compétitions microbiennes au sein de différents microbiotes, comme le microbiote intestinal, en vue d’applications en médecine humaine ou vétérinaire.
Proceedings
Identification of Lasso and Branched-Cyclic Topoisomers Using Trapped Ion Mobility Spectrometry – Mass Spectrometry and Ion Spectroscopy
K Jeanne Dit Fouque1; J D. Hegemann2; S Zirah3; S Rebuffat3; P Maitre4; F Fernandez-Lima1
Proceedings 65th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics 2018 (San Diego CA, USA, 3-7 juin 2018)
Brevets
Dérivés de la purine pour leur utilisation dans le traitement ou la prévention de maladies dues à une mutation non-sens
S. Amand, F. Lejeune, C. Maulay-Bailly, S. Rebuffat
FR1660244, dépôt le 21.10.2016.
PCT/EP2017/076846, dépôt le 20.10.2017.
Lepista flaccida destiné à être utilisé dans le traitement d’une maladie due à une mutation non-sens
S. Amand, F. Lejeune, C. Maulay-Bailly, S. Rebuffat
FR1660229, dépôt le 21.10.2016
PCT/EP2017/076848, dépôt le 20.10.2017.
Publications
2023
- , 2023 — Use of 2,6-diaminopurine as a potent suppressor of UGA premature stop codons in cystic fibrosis. Molecular Therapy , ,ISSN1525-0016
2022
- , 2022 — Impact of microcin J25 on the porcine microbiome in a continuous culture model. Frontiers in Microbiology vol. 13, , p. 930392ISSN1664-302X
- , 2022 — Ribosomally synthesized peptides, foreground players in microbial interactions: recent developments and unanswered questions. Natural Product Reports vol. 39, n° 2, p. 273-310ISSN1460-4752
- , 2022 — Gastrointestinal Stability and Cytotoxicity of Bacteriocins From Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria: A Comparative in vitro Study. Frontiers in Microbiology vol. 12, , p. 780355ISSN1664-302X
- , 2022 — Structure of Lacticaseicin 30 and Its Engineered Variants Revealed an Interplay between the N-Terminal and C-Terminal Regions in the Activity against Gram-Negative Bacteria. Pharmaceutics vol. 14, n° 9, p. 1921ISSN1999-4923
2021
- , 2021 — New developments in RiPP discovery, enzymology and engineering. Natural Product Reports vol. 38, n° 1, p. 130-239ISSN0265-0568, 1460-4752
- , 2021 — Bacteriocins as a new generation of antimicrobials: toxicity aspects and regulations. FEMS Microbiology Reviews vol. 45, n° 1,ISSN0168-6445
- , 2021 — Structural Insights from Tandem Mass Spectrometry, Ion Mobility-Mass Spectrometry, and Infrared/Ultraviolet Spectroscopy on Sphingonodin I: Lasso vs Branched-Cyclic Topoisomers. Journal of the American Society for Mass Spectrometry vol. 32, n° 4, p. 1096-1104ISSN1044-0305
- , 2021 — Molecular mechanism of SbmA, a promiscuous transporter exploited by antimicrobial peptides. Science Advances vol. 7, n° 37, eabj5363
2020
- , 2020 — 2,6-Diaminopurine as a highly potent corrector of UGA nonsense mutations. Nature Communications vol. 11, n° 1, p. 1509ISSN2041-1723