Entité de rattachement
BIM Biochimie des Interactions Microbiennes
Thème interdisciplinaire de recherche
Méthodes spectroscopiques (RMN, spectrométrie de masse), Biochimie.
Recherches
Habilité(e) à diriger des recherches

Contact

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Courriel
severine.zirah [at] mnhn.fr
Téléphone
01 40 79 31 40
Adresse(s)

63 rue Buffon
75005 Paris

Responsabilités dans l'unité

  • Coordinatrice (avec Benjamin Marie) des plateaux techniques de RMN et de spectrométrie de masse bio-organique du Muséum
  • Co-organisation des séminaires d'unité
  • Membre élu au conseil d'unité

Enseignements

  • Membre du Conseil de l'Ecole Doctorale 227 « Sciences de la Nature et de l'Homme : évolution et écologie » (Muséum national d’Histoire naturelle, Université Pierre et Marie Curie)
  • Co-responsable de la thématique de Master 2 « Molécules et Cibles Thérapeutiques » (MCT) inscrit dans le Master «Biologie Moléculaire et Cellulaire », Parcours type « Biochimie et Biologie Moléculaire » de Sorbonne Université et le Master « Biodiversité, Ecologie et Evolution », Parcours « Environnement Santé » du Muséum
  • Co-responsable des UEs ES6 : Molécules de défense et de communication des microorganismes, ES21 : Caractérisation, rôle et valorisation des molécules microbiennes, ES30 : Métabolites secondaires microbiens : de l'esploration de génomes à la caractérisation structurale, ES36 : Molécules et cibles thérapeutiques, ES15 : Satge de recherche

 

  • Cours et TD de méthodes spectroscopiques (RMN, spectrométrie de masse) appliqués à la caractérisation de peptides. Modules de M2 MVE (MVE21 parcours ES (ES21 thématique MES et ES36 thématique MCT)

  • Cours de métabolomique. Modules de M1 (MU4BM131, Sorbonne Université)

  • Cours sur la diversité et le rôle molécules microbiennes (antibiotiques, protéines de transport, molécules du quorum sensing…). Modules de M1 ES : ESE6

  • Cours de statistiques : introduction à R, statistiques descriptives, statistiques multivariées. Modules de M1 (TC3ini, TC3), M2 (SEP36) et modules d’école doctorale R applications et R analyses multivariées

  • Cours, TD et atelier de spectrométrie de masse, atelier de RMN, Licence Professionnelle « Développement du médicament » , IUT de Créteil

Présentation

Activités de recherche

Peptides issus de la voie de biosynthèse ribosomale avec modifications post-traductionnelles (RiPPs) d’origine bactérienne : méthodes spectroscopiques globales et ciblées pour la caractérisation de RiPPs et la compréhension de leur rôle physiologique
Glycosylation des protéines de couche S et rôle dans tolérance des bactéries aux métaux et radionucléides
Protéomique appliquée à l’archéozoologie.

Publications

2023
  • Favreau Charly, Tribondeau Alicia, Marugan Marie, Guyot François, Alpha-Bazin Beatrice, Marie Arul, Puppo Remy, Dufour Thierry, Huguet Arnaud, Zirah Séverine & Kish Adrienne, 2023 — Molecular acclimation of Halobacterium salinarum to halite brine inclusions. Frontiers in Microbiology vol. 13, , p. 1075274
    ISSN
    1664-302X
    https://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2022.1075274
2022
  • Naimi Sabrine, Zirah Séverine, Greppi Anna, Lacroix Christophe, Rebuffat Sylvie & Fliss Ismail, 2022 — Impact of microcin J25 on the porcine microbiome in a continuous culture model. Frontiers in Microbiology vol. 13, , p. 930392
    ISSN
    1664-302X
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2022.930392
  • Soltani Samira, Zirah Séverine, Rebuffat Sylvie, Couture Frédéric, Boutin Yvan, Biron Eric, Subirade Muriel & Fliss Ismail, 2022 — Gastrointestinal Stability and Cytotoxicity of Bacteriocins From Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria: A Comparative in vitro Study. Frontiers in Microbiology vol. 12, , p. 780355
    ISSN
    1664-302X
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2021.780355
  • Zhang Liya, Ben Said Laila, Hervé Nadège, Zirah Séverine, Diarra Moussa Sory & Fliss Ismail, 2022 — Effects of drinking water supplementation with Lactobacillus reuteri, and a mixture of reuterin and microcin J25 on the growth performance, caecal microbiota and selected metabolites of broiler chickens. Journal of Animal Science and Biotechnology vol. 13, , p. 34
    ISSN
    2049-1891
    https://dx.doi.org/10.1186/s40104-022-00683-6
2021
  • Azémard Clara, Dufour Elise, Zazzo Antoine, Wheeler Jane C., Goepfert Nicolas, Marie Arul & Zirah Séverine, 2021 — Untangling the fibre ball: Proteomic characterization of South American camelid hair fibres by untargeted multivariate analysis and molecular networking. Journal of Proteomics vol. 231, , p. 104040
    ISSN
    1874-3919
    https://dx.doi.org/10.1016/j.jprot.2020.104040
2020
  • Le Meillour Louise, Zirah Séverine, Zazzo Antoine, Cersoy Sophie, Détroit Florent, Imalwa Emma, Lebon Matthieu, Nankela Alma, Tombret Olivier, Pleurdeau David & Lesur Joséphine, 2020 — Palaeoproteomics gives new insight into early southern African pastoralism. Scientific Reports vol. 10, n° 1, p. 14427
    ISSN
    2045-2322
    https://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-71374-3
  • Naimi Sabrine, Zirah Séverine, Taher Menel Ben, Theolier Jérémie, Fernandez Benoît, Rebuffat Sylvie & Fliss Ismail, 2020 — Microcin J25 Exhibits Inhibitory Activity Against Salmonella Newport in Continuous Fermentation Model Mimicking Swine Colonic Conditions. Frontiers in Microbiology vol. 11, , p. 988
    ISSN
    1664-302X
    https://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2020.00988
  • Said Laila Ben, Emond‐Rheault Jean-Guillaume, Soltani Samira, Telhig Sofiane, Zirah Séverine, Rebuffat Sylvie, Diarra Moussa Sory, Goodridge Lawrence, Levesque Roger C. & Fliss Ismail, 2020 — Phenomic and genomic approaches to studying the inhibition of multiresistant Salmonella enterica by microcin J25. Environmental Microbiology vol. 22, n° 7, p. 2907-2920
    ISSN
    1462-2920
    https://dx.doi.org/https://doi.org/10.1111/1462-2920.15045
  • Telhig Soufiane, Ben Said Laila, Zirah Séverine, Fliss Ismail & Rebuffat Sylvie, 2020 — Bacteriocins to Thwart Bacterial Resistance in Gram Negative Bacteria. Frontiers in Microbiology vol. 11, ,
    ISSN
    1664-302X
    https://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2020.586433
2019
  • Azémard Clara, Zazzo Antoine, Marie Arul, Lepetz Sébastien, Debaine-Francfort Corinne, Idriss Abduressul & Zirah Séverine, octobre 2019 — Animal fibre use in the Keriya valley (Xinjiang, China) during the Bronze and Iron Ages: A proteomic approach. Journal of Archaeological Science vol. 110, , p. 104996
    ISSN
    0305-4403
    https://dx.doi.org/10.1016/j.jas.2019.104996
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