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Equipe MDCEM
Molécules de défense et de communication dans les écosystèmes microbiens

Thèses et HDR soutenues

2012
Séverine Zirah
Méthodes spectroscopiques pour la caractérisation structurale de biopolymères et l’ecologie chimique
Habilitation à Diriger des Recherches de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris 6)
Soutenance le 13 décembre 2012 devant le jury composé de MurielDELEPIERRE, ClaudeGRISON, Edwin DE PAW, Jean-Michel CAMADRO, Delphine DESTOUMIEUX-GARZÓN, Olivier LEQUIN, Sylvie REBUFFAT
Rémi Ducasse
Etude structurale et fonctionnelle de peptides lasso à l'aide de méthodes spectroscopiques
Doctorat de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris 6, Ecole doctorale Iviv) sous la direction de Sylvie REBUFFAT
Soutenance le 29 octobre 2012 à 14h30 devant le jury composé de Mr Jean-Marc BERJEAUD, Mme Isabelle SEGALAS-MILAZZO, Mr Thierry FOULON, Mme Agnès DELMAS, Mr Ewen LESCOP, Mme Séverine ZIRAH, Mme Sylvie REBUFFAT

Résumé
Les peptides lasso sont des peptides synthétisés par les bactéries selon la voie ribosomale et qui subissent des modifications post-traductionnelles, leur conférant une topologie remarquable incluant un nœud moléculaire. Ils possèdent un cycle macrolactame N-terminal, dans lequel est insérée et piégée la queue C-terminale. Cette topologie est stabilisée par des contraintes stériques et/ou des ponts disulfure. Leurs propriétés biologiques (antagonistes de récepteurs, inhibiteurs d’enzymes pouvant leur conférer des propriétés antivirales ou antibactériennes) et la très grande stabilité de leur structure « lasso » leur confèrent un fort attrait biotechnologique. Ce travail de thèse s’inscrit dans le contexte, de découverte de nouveaux peptides lasso et de compréhension des éléments de séquence gouvernant la topologie et l’activité de ces peptides, à travers le développement de méthodes spectroscopiques.

 
2011
Kok-Phen Yan
Mécanismes moléculaires gouvernant la biosynthèse des peptides lasso, peptides bioactifs bactériens : cas de la microcine J25
Doctorat de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris 6, Ecole doctorale Iviv) sous la direction de Sylvie REBUFFAT
Soutenance le 25 novembre 2011 à 14h30 dans le grand amphithéâtre d'entomologie (45 rue Buffon), devant un jury composé de Mr David PIGNOL, Mme Muriel GONDRY, Mr Michel MORANGE, Mme Flavia MARINELLI, Mme Tula SAISON-BEHMOARAS, Mme Yanyan LI, Mme Sylvie REBUFFAT
Kahina Maya Makhloufi
Caractérisation d'une bactériocine produite par une bactérie lactique Leuconostoc pseudomesenteroides isolée du boza 
Doctorat de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris 6, Ecole doctorale Iviv) sous la direction de Sylvie REBUFFAT
Soutenance le 8 juillet 2011 à 14h30 en salle des collections (63 rue Buffon), devant un jury composé de Mr Mohamed AMICHE, Mr Djamel DRIDER, Mr Ali LADRAM, Mr Germain TRUGNAN, Mme Sylvie REBUFFAT
Mélanie Roué
Contribution de la flore bacterienne associée au métabolisme secondaire de l'éponge calcaire Clathrina clathrus
Doctorat de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris VI, Ecole doctorale Iviv) sous la direction de Marie-Lise BOURGUET-KONDRACKI
Soutenance le 30 mai 2011 à 14h30 en salle des collections (63 rue Buffon), devant un jury composé de Mme Claude GRISON, M. Xavier TURON, M. Gilles BOEUF, Mr Gilles COMTE, M. Jean VACELET, Mme Marie-Lise BOURGUET-KONDRACKI
2010
Elodie Quévrain
Etude chimique et microbiologique d'un écosystème bactérien: cas de l'éponge calcaire Leuconia johnstoni
Doctorat de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris VI) sous la direction de Marie-Lise BOURGUET-KONDRACKI
Soutenance le 25 juin 2010, devant un jury composé de Mme Christine PAILLARD, M. François TILLEQUIN, Mme Isabelle DOMART-COULON, Mme Paola FURLA, M. Bernard KLOAREG, M. Michael MANUEL, Mme Marie-Lise BOURGUET-KONDRACKI
2009
Vanessa Petit
Peptides antimicrobiens de procaryotes et d'eucaryotes : des structures aux mécanismes d'action
Doctorat de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris 6) sous la direction de Sylvie REBUFFAT
Soutenance le 26 juin 2009
Gaëlle Vassiliadis
Biosynthèse et mécanisme d'action des microcines sidérophores, peptides antibactériens sécrétés par les entérobactéries
Doctorat de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris 6) sous la direction de Sylvie REBUFFAT et Jean PEDUZZI
Soutenance le 29 mai 2009
2007
Sophie Duquesne
Peptides antimicrobiens des entérobactéries - Etude de la voie de maturation et du mécanisme d'import de la microcine J25, peptide antimicrobien inhibiteur de l'ARN polymérase
Doctorat de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris 6) sous la direction de Sylvie REBUFFAT
Soutenance le 14 mai 2007
2005
Xavier Thomas
Peptides antimicrobiens des entérobactéries. La microcine E492 est un peptide-sidérophore qui parasite les voies d'import du fer
Doctorat de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris 6) sous la direction de Sylvie REBUFFAT
Soutenance le 2 mars 2005
Laurent Calcul
Etudes chimique et biologique de trois Eponges marines: Podospongia aff. loveni , Siphonochalina sp. et Xestospongia sp.- Isolement-bioactivité-approche de synthèse d'alcaloïdes de type benzo[ de ][1,6] naphthyridine isolés de Xestospongia sp.
Doctorat du Muséum National d'Histoire Naturelle sous la direction de Marie-Lise BOURGUET-KONDRACKI
Soutenance le 30 septembre 2005
Pierre Sauleau
Etude chimique et pharmacologique des éponges de Mer Rouge : Lamellodysidea herbacea et Hyrtios erectus
Doctorat du Muséum National d'Histoire Naturelle sous la direction de Marie-Lise BOURGUET-KONDRACKI
Soutenance le 13 décembre 2005
 
 
 
   
 
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Molécules de Communication et Adaptation
des Micro-organismes (MCAM)
UMR 7245 CNRS/MNHN